<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Rupert,<div><br></div><div><br></div><div>I took out the OtsuThreshold filter and the resulting timings for ITKv3 and ITKv4 were comparable for your Filter Chain. More than half the time was spend in this one filter.</div><div><br></div><div>Also the computed stddev results do not appear to be correct. However looking at the code it looks right.</div><div><br></div><div>Brad</div><div><br><div><div>On Jul 25, 2012, at 11:53 AM, Rupert Brooks wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite">Brad,<div><br></div><div>Agreed, VS2005 is not my favorite either, which is why im doing tests also with a recent gcc. &nbsp;If the performance degradation was limited to VS2005, that would not be a big deal in my view. &nbsp; I'm stuck with it at the moment, but I can hardly expect you folks to do your best work for it.</div>
<div><br></div><div>If and when i give other compilers a shot, i will keep you posted.</div><div><br></div><div>Rupert<br clear="all">--------------------------------------------------------------<br>Rupert Brooks<br><a href="mailto:rupert.brooks@gmail.com">rupert.brooks@gmail.com</a><br>
<br>
<br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jul 25, 2012 at 10:52 AM, Bradley Lowekamp <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:blowekamp@mail.nih.gov" target="_blank">blowekamp@mail.nih.gov</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div style="word-wrap:break-word">Hello Rupert,<div><br></div><div>I see you are still using Visual Studio 8 2005, I am curious how VS10 would compare. I know that there are a couple special case optimization added to ITKv4 which VS8 is not able to take advantage off.&nbsp;</div>
<div><br></div><div>As others have reported we are begining to address some of these issues.</div><div><br></div><div>Thanks for sharing!</div><div>Brad</div><div><br><div><div><div class="h5"><div>On Jul 25, 2012, at 10:12 AM, Rupert Brooks wrote:</div>
<br></div></div><blockquote type="cite"><div><div class="h5"><div>Hi,</div><div><br></div><div>I was commenting the other day that ITK4 seems to have lower performance than ITK3. &nbsp;I put together a little benchmark to test this objectively. &nbsp;Results for a couple of systems are below. &nbsp;The benchmark is neither particularly sophisticated nor exact, but i have tried to make it typical of what i use ITK for. &nbsp;I have not tried it with Hans' patch as that got abandoned. &nbsp;Will follow up separately on that.</div>

<div><br></div><div>In the numbers below, you will see that performance seems to have degraded across the board. &nbsp;One exception is the 2D image test. &nbsp;In this test i was lazy, and i left the image axis aligned with unit spacing. &nbsp;I am suspecting a special case optimization in ITK4. &nbsp;At the moment, this blocks my ability to upgrade my projects to ITK4, as they are performance critical. &nbsp;Any hints and tips to get those milliseconds back will be much appreciated.</div>

<div><br></div><div>The code is at&nbsp;<a href="https://github.com/rupertbrooks/itkbench" target="_blank">https://github.com/rupertbrooks/itkbench</a>, i'd be curious if others get the same results, and of course, criticism and improvements are welcome.&nbsp;</div>


<div><br></div><div>Note that the output about what processor / cores is on the system is bogus. The windows system is a core i7 with 4 cores, the linux one is a Core2 Quad. &nbsp;I suspect a bug in itksys::SystemInformation, but i will follow up on that separately also. &nbsp;</div>

<div><br></div><div>In all itk builds, ITK_USE_REVIEW is on. &nbsp;In the itk3 builds, USE_OPTIMZIZED_REGISTRATION, and the new statistics framework are turned on.</div><div><br></div><div>Cheers,</div><div>Rupert</div><div><br>

</div><div>Data follows.....</div>
<div><br></div><div>itk3 Windows XP 32bit Visual Studio Pro 2005 &nbsp;Build RelWithDebInfo&nbsp;</div><div><div>System: CAMD5C5PMN1</div><div>Processor: Pentium III (0.18 micron) With 1 Or 2 MB On-Die L2 Cache&nbsp;</div><div>&nbsp;Serial #:&nbsp;</div>

<div>&nbsp; &nbsp; Cache: -1</div><div>&nbsp; &nbsp; Clock: 2800</div><div>&nbsp; &nbsp; Cores: 4 cpus x 1 Cores = 4</div><div>OSName: &nbsp; &nbsp; Windows</div><div>&nbsp; Release: &nbsp;XP Professional</div><div>&nbsp; Version: &nbsp;Service Pack 3 (Build 2600)</div><div>&nbsp; Platform: x86</div>

<div>&nbsp; Operating System is 32 bit</div><div>ITK Version: 3.20.0</div><div>Virtual Memory: Total: 2047 Available: 2021</div><div>Physical Memory: Total:3581 Available: 1457</div><div>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Probe Name: &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Count &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Min &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; Mean &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; Stdev &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Max &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Total&nbsp;</div>

<div>&nbsp;FilterChain_1_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; 0.0345688 &nbsp; &nbsp; 0.0361805 &nbsp; &nbsp; 0.0381523 &nbsp; &nbsp; 0.0375099 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.361805</div><div>&nbsp;FilterChain_2_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; 0.0257301 &nbsp; &nbsp; 0.0265144 &nbsp; &nbsp; 0.0279574 &nbsp; &nbsp; 0.0282478 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.265144</div>

<div>&nbsp;FilterChain_3_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.022007 &nbsp; &nbsp; 0.0232452 &nbsp; &nbsp; 0.0245125 &nbsp; &nbsp; 0.0240822 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.232452</div><div>&nbsp;FilterChain_4_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; 0.0199661 &nbsp; &nbsp; 0.0221756 &nbsp; &nbsp; 0.0235205 &nbsp; &nbsp; 0.0288773 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.221756</div>

<div>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Image2D &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.144909 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 0.14665 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.154586 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.148136 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;1.4665</div><div>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Image3D &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 0.19125 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.193378 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.203846 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.196495 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 1.93378</div>

<div>&nbsp;MeanSquares_1_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.612728 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.616159 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.649503 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.627789 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 6.16159</div><div>&nbsp;MeanSquares_2_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.359703 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.368051 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.388106 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.392696 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 3.68051</div>

<div>&nbsp;MeanSquares_3_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.268024 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.280672 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.296142 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.312557 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 2.80672</div><div>&nbsp;MeanSquares_4_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.199249 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.213209 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.224918 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.2243 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 2.13209</div>

</div><div><br></div><div><div><br></div><div>itk4 Windows XP 32bit Visual Studio Pro 2005&nbsp;&nbsp;Build RelWithDebInfo</div><br>
</div><div><div><div>System: CAMD5C5PMN1</div><div>Processor: Pentium III (0.18 micron) With 1 Or 2 MB On-Die L2 Cache&nbsp;</div><div>&nbsp;Serial #:&nbsp;</div><div>&nbsp; &nbsp; Cache: -1</div><div>&nbsp; &nbsp; Clock: 2800</div><div>&nbsp; &nbsp; Cores: 4 cpus x 1 Cores = 4</div>

<div>OSName: &nbsp; &nbsp; Windows</div><div>&nbsp; Release: &nbsp;XP Professional</div><div>&nbsp; Version: &nbsp;Service Pack 3 (Build 2600)</div><div>&nbsp; Platform: x86</div><div>&nbsp; Operating System is 32 bit</div><div>ITK Version: 4.3.0</div><div>Virtual Memory: Total: 2047 Available: 2008</div>

<div>Physical Memory: Total:3581 Available: 1574</div><div>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Probe Name: &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Count &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Min &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; Mean &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; Stdev &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Max &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Total&nbsp;</div><div>&nbsp;FilterChain_1_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; 0.0797005 &nbsp; &nbsp; 0.0808155 &nbsp; &nbsp; 0.0851898 &nbsp; &nbsp; 0.0820313 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.808155</div>

<div>&nbsp;FilterChain_2_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; 0.0670509 &nbsp; &nbsp; 0.0921925 &nbsp; &nbsp; 0.0991914 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.109177 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.921925</div><div>&nbsp;FilterChain_3_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; 0.0648499 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.113566 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.120975 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.125893 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 1.13566</div>

<div>&nbsp;FilterChain_4_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; 0.0536919 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.104662 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.114558 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.132114 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 1.04662</div><div>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Image2D &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; 0.0953979 &nbsp; &nbsp; 0.0965282 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.101753 &nbsp; &nbsp; 0.0978088 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.965282</div>

<div>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Image3D &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.196468 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.198288 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.209017 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.200562 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 1.98288</div><div>&nbsp;MeanSquares_1_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.982071 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.986089 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 1.03944 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.996445 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 9.86089</div>

<div>&nbsp;MeanSquares_2_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.686028 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.728621 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.768821 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.799675 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 7.28621</div><div>&nbsp;MeanSquares_3_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.534885 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.554387 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.5846 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.578133 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 5.54387</div>

<div>&nbsp;MeanSquares_4_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.441551 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.463463 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.488903 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.502502 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 4.63463</div></div><div><br></div><div><br></div><div>itk3 Linux 64 bit gcc 4.6.1 Build Release</div><div>System: morrigan</div>

<div>Processor: Intel(R) Core(TM)2 Duo CPU &nbsp; &nbsp; T9500 &nbsp;@ 2.60GHz</div><div>&nbsp;Serial #:</div><div>&nbsp; &nbsp; Cache: 2048</div>
<div>&nbsp; &nbsp; Clock: 2003</div><div>&nbsp; &nbsp; Cores: 4 cpus x 4 Cores = 16</div><div>OSName: &nbsp; &nbsp; Linux</div><div>&nbsp; Release: &nbsp;3.0.0-21-generic</div><div>&nbsp; Version: &nbsp;#35-Ubuntu SMP Fri May 25 17:57:41 UTC 2012</div><div>&nbsp; Platform: x86_64</div>


<div>&nbsp; Operating System is 64 bit</div><div>ITK Version: 3.20.1</div><div>Virtual Memory: Total: 20795 Available: 20795</div><div>Physical Memory: Total:8001 Available: 3416</div><div>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Probe Name: &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Count &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Min &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; Mean &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; Stdev</div>


<div>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Max &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Total</div><div>&nbsp;FilterChain_1_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; 0.0309269 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.031097 &nbsp; &nbsp; 0.0327796&nbsp; &nbsp; 0.031528 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 0.31097</div><div>&nbsp;FilterChain_2_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.021672 &nbsp; &nbsp; 0.0248219 &nbsp; &nbsp; 0.0261976&nbsp; &nbsp; 0.026264 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.248219</div>


<div>&nbsp;FilterChain_3_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; 0.0213931 &nbsp; &nbsp; 0.0217796 &nbsp; &nbsp; 0.0229634&nbsp; &nbsp;0.0228851 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.217796</div><div>&nbsp;FilterChain_4_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; 0.0198419 &nbsp; &nbsp; 0.0207421 &nbsp; &nbsp; 0.0218725&nbsp; &nbsp;0.0216701 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.207421</div>


<div>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Image2D &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; 0.0263629 &nbsp; &nbsp; 0.0264159 &nbsp; &nbsp; 0.0278451&nbsp; &nbsp;0.0267591 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.264159</div><div>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Image3D &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; 0.0263779 &nbsp; &nbsp; 0.0263906 &nbsp; &nbsp; 0.0278181&nbsp; &nbsp; 0.026463 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.263906</div>


<div>&nbsp;MeanSquares_1_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.463909 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.465901 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.491113&nbsp; &nbsp; 0.473644 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 4.65901</div><div>&nbsp;MeanSquares_2_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.349138 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 0.40529 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.429438&nbsp; &nbsp; 0.487785 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;4.0529</div>


<div>&nbsp;MeanSquares_3_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.331908 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.357685 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.377834&nbsp; &nbsp; 0.400941 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 3.57685</div><div>&nbsp;MeanSquares_4_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.299428 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.336914 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.356878&nbsp; &nbsp; 0.395144 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 3.36914</div>


<div><br></div><div>itk4 Linux 64-bit gcc 4.6.1&nbsp;Build Release</div></div><div>System: morrigan</div><div>Processor: Intel(R) Core(TM)2 Duo CPU &nbsp; &nbsp; T9500 &nbsp;@ 2.60GHz</div><div>&nbsp;Serial #:</div><div>&nbsp; &nbsp; Cache: 2048</div><div>


&nbsp; &nbsp; Clock: 2003</div><div>&nbsp; &nbsp; Cores: 4 cpus x 4 Cores = 16</div><div>OSName: &nbsp; &nbsp; Linux</div><div>&nbsp; Release: &nbsp;3.0.0-21-generic</div><div>&nbsp; Version: &nbsp;#35-Ubuntu SMP Fri May 25 17:57:41 UTC 2012</div><div>&nbsp; Platform: x86_64</div>


<div>&nbsp; Operating System is 64 bit</div><div>ITK Version: 4.3.0</div><div>Virtual Memory: Total: 20795 Available: 20795</div><div>Physical Memory: Total:8001 Available: 3400</div><div>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Probe Name: &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Count &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Min &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; Mean &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; Stdev</div>


<div>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Max &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Total</div><div>&nbsp;FilterChain_1_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; 0.0663331 &nbsp; &nbsp; 0.0668247 &nbsp; &nbsp; 0.0704416&nbsp; &nbsp;0.0681288 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.668247</div><div>&nbsp;FilterChain_2_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.0353 &nbsp; &nbsp; 0.0393441 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.042048&nbsp; &nbsp;0.0534279 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.393441</div>


<div>&nbsp;FilterChain_3_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.025275 &nbsp; &nbsp; 0.0265869 &nbsp; &nbsp; 0.0282408&nbsp; &nbsp;0.0364931 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.265869</div><div>&nbsp;FilterChain_4_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; 0.0208249 &nbsp; &nbsp; 0.0222288 &nbsp; &nbsp; 0.0235333&nbsp; &nbsp; 0.028336 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.222288</div>


<div>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Image2D &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.026361 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.026421 &nbsp; &nbsp; 0.0278503&nbsp; &nbsp;0.0266371 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 0.26421</div><div>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Image3D &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; 0.0263991 &nbsp; &nbsp; 0.0266509 &nbsp; &nbsp; 0.0280954&nbsp; &nbsp;0.0274949 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.266509</div>


<div>&nbsp;MeanSquares_1_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 0.69005 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 0.69459 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.732169&nbsp; &nbsp; 0.701676 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;6.9459</div><div>&nbsp;MeanSquares_2_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.590396 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.699826 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.739994&nbsp; &nbsp; 0.766702 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 6.99826</div>


<div>&nbsp;MeanSquares_3_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.527146 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.538844 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.568047&nbsp; &nbsp; 0.548791 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 5.38844</div><div>&nbsp;MeanSquares_4_threads &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;10 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.417008 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.454278 &nbsp; &nbsp; &nbsp;0.480139&nbsp; &nbsp; 0.533593 &nbsp; &nbsp; &nbsp; 4.54278</div>


<div>--------------------------------------------------------------</div>Rupert Brooks<br><a href="mailto:rupert.brooks@gmail.com" target="_blank">rupert.brooks@gmail.com</a><br><br></div></div><div class="im">
_______________________________________________<br>Powered by <a href="http://www.kitware.com/" target="_blank">www.kitware.com</a><br><br>Visit other Kitware open-source projects at<br><a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
<br>Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br><a href="http://kitware.com/products/protraining.php" target="_blank">http://kitware.com/products/protraining.php</a><br><br>Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
<a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br><br>Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br><a href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-developers" target="_blank">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-developers</a><br>
</div></blockquote></div><br><div>
<span style="text-indent:0px;letter-spacing:normal;font-variant:normal;text-align:-webkit-auto;font-style:normal;font-weight:normal;line-height:normal;border-collapse:separate;text-transform:none;font-size:medium;white-space:normal;font-family:Helvetica;word-spacing:0px"><span style="text-indent:0px;letter-spacing:normal;font-variant:normal;font-style:normal;font-weight:normal;line-height:normal;border-collapse:separate;text-transform:none;font-size:12px;white-space:normal;font-family:Helvetica;word-spacing:0px"><div style="word-wrap:break-word">
<span style="text-indent:0px;letter-spacing:normal;font-variant:normal;font-style:normal;font-weight:normal;line-height:normal;border-collapse:separate;text-transform:none;font-size:12px;white-space:normal;font-family:Helvetica;word-spacing:0px"><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">
<font face="Helvetica" size="3" style="font:normal normal normal 12px/normal Helvetica">========================================================</font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">
<font face="Helvetica" size="3" style="font:normal normal normal 12px/normal Helvetica">Bradley Lowekamp<span>&nbsp;</span><span>&nbsp;</span></font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font:normal normal normal 12px/normal Helvetica">Medical Science and Computing for</font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font:normal normal normal 12px/normal Helvetica">Office of High Performance Computing and Communications</font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font:normal normal normal 12px/normal Helvetica">National Library of Medicine<span>&nbsp;</span></font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">
<font face="Helvetica" size="3" style="font:normal normal normal 12px/normal Helvetica"><a href="mailto:blowekamp@mail.nih.gov" target="_blank">blowekamp@mail.nih.gov</a></font></div><br></span></div></span></span><br>
</div>
<br></div></div></blockquote></div><br></div>
</blockquote></div><br><div>
<span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; -webkit-text-decorations-in-effect: none; text-indent: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; text-transform: none; orphans: 2; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; -webkit-text-decorations-in-effect: none; text-indent: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; text-transform: none; orphans: 2; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; "><p style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; ">========================================================</font></p><p style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; ">Bradley Lowekamp<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span><span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span></font></p><p style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; ">Medical Science and Computing for</font></p><p style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; ">Office of High Performance Computing and Communications</font></p><p style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; ">National Library of Medicine<span class="Apple-converted-space">&nbsp;</span></font></p><p style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; "><a href="mailto:blowekamp@mail.nih.gov">blowekamp@mail.nih.gov</a></font></p><br class="Apple-interchange-newline"></span></div></span></span><br class="Apple-interchange-newline">
</div>
<br></div></body></html>