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Hi Luis\All<br><br>I was going through the example and I think ImageKmeansModelEstimator is a good way to go ahead with K-Means. But my basic problem is I'm using ITK wrapped with Python and hence none of the C++ classes and header files are available in my Python module. Porting all of the code might be a tiresome task. Do you have any suggestions on how to proceed.<br><br>Regards<br>Tom<br><br><br>&gt; Date: Fri, 19 Sep 2008 09:28:43 -0400<br>&gt; From: luis.ibanez@kitware.com<br>&gt; To: tomnash1@hotmail.com<br>&gt; CC: insight-users@itk.org<br>&gt; Subject: Re: [Insight-users] Multi-Spectral segmentation<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; Hi Tom,<br>&gt; <br>&gt; For running K-Means on a multi-spectral image you may want to use:<br>&gt; <br>&gt; http://www.itk.org/Insight/Doxygen/html/classitk_1_1ImageKmeansModelEstimator.html<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt;    Regards,<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt;       Luis<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; ---------------<br>&gt; Tom Nash wrote:<br>&gt; &gt; Hi Luis<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; Thank you for letting me know. I am Thinking to first segment a single <br>&gt; &gt; MRI using K-means and later try multi-spectral segmentation on the other <br>&gt; &gt; slices. Any pointers for k-means other than the K-means classification <br>&gt; &gt; example given in the guide?<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; Regards<br>&gt; &gt; Tom Nash<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt;  &gt; Date: Sun, 14 Sep 2008 10:50:48 -0400<br>&gt; &gt;  &gt; From: luis.ibanez@kitware.com<br>&gt; &gt;  &gt; To: tomnash1@hotmail.com<br>&gt; &gt;  &gt; CC: insight-users@itk.org<br>&gt; &gt;  &gt; Subject: Re: [Insight-users] Multi-Spectral segmentation<br>&gt; &gt;  &gt;<br>&gt; &gt;  &gt;<br>&gt; &gt;  &gt; Hi Tom,<br>&gt; &gt;  &gt;<br>&gt; &gt;  &gt; You may want to explore the following:<br>&gt; &gt;  &gt;<br>&gt; &gt;  &gt; 1) Region Growing with based on Mahalanobis distance.<br>&gt; &gt;  &gt; <br>&gt; &gt; http://www.itk.org/Insight/Doxygen/html/classitk_1_1VectorConfidenceConnectedImageFilter.html<br>&gt; &gt;  &gt;<br>&gt; &gt;  &gt;<br>&gt; &gt;  &gt; 2) Statistical classifiers<br>&gt; &gt;  &gt;<br>&gt; &gt;  &gt; See examples in<br>&gt; &gt;  &gt;<br>&gt; &gt;  &gt; Insight/Examples/Statistics<br>&gt; &gt;  &gt;<br>&gt; &gt;  &gt;<br>&gt; &gt;  &gt;<br>&gt; &gt;  &gt; Regards,<br>&gt; &gt;  &gt;<br>&gt; &gt;  &gt;<br>&gt; &gt;  &gt; Luis<br>&gt; &gt;  &gt;<br>&gt; &gt;  &gt;<br>&gt; &gt;  &gt; --------------<br>&gt; &gt;  &gt; Tom Nash wrote:<br>&gt; &gt;  &gt; &gt; Hi all<br>&gt; &gt;  &gt; &gt;<br>&gt; &gt;  &gt; &gt; I wish to implement a multi-spectral segmentation of Brain MRIs. Any<br>&gt; &gt;  &gt; &gt; pointers on how to go about doing doing it? I am familiar with 2D<br>&gt; &gt;  &gt; &gt; segmentations using thresholding and region growing techniques. I am<br>&gt; &gt;  &gt; &gt; planning to use ITK wrapped with Python for this. Do I need ITK-SNAP?<br>&gt; &gt;  &gt; &gt;<br>&gt; &gt;  &gt; &gt; Regards<br>&gt; &gt;  &gt; &gt; Tom<br>&gt; &gt;  &gt; &gt;<br>&gt; &gt;  &gt; &gt; _______________________________________________<br>&gt; &gt;  &gt; &gt; Insight-users mailing list<br>&gt; &gt;  &gt; &gt; Insight-users@itk.org<br>&gt; &gt;  &gt; &gt; http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; ------------------------------------------------------------------------<br>&gt; &gt; Watch useful tips on recipes, fitness, yoga and fashion only on MSN <br>&gt; &gt; videos. Try it! &lt;http://video.msn.com/?mkt=en-in&gt;<br><br /><hr />Watch useful tips on recipes, fitness, yoga and fashion only on MSN videos. <a href='http://video.msn.com/?mkt=en-in' target='_new'>Try it!</a></body>
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