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<body class='hmmessage'>
Hi again,<BR>
&nbsp;<BR>
I made a MateImage with the link you passed me, but there is said: "Once you write this header text file, it should be possible to read the image into your ITK based application using the <A href="http://www.itk.org/Insight/Doxygen/html/classitk_1_1FileIOToImageFilter.html"><U><FONT color=#800080>itk::FileIOToImageFilter</FONT></U></A> class." But I can´t find that class in the documentation. What should i use to read the image?<BR>
&nbsp;<BR>
Thank you.<BR><BR>&gt; Date: Wed, 22 Oct 2008 12:33:06 +0200<BR>&gt; From: xabiarta@unav.es<BR>&gt; To: insight-users@itk.org<BR>&gt; Subject: Re: [Insight-users] 3D registration problem<BR>&gt; <BR>&gt; Hi Manuel,<BR>&gt; Yes, once you read the image it becomes an ITK image of any dimension, <BR>&gt; for example 3. If you read it correctly, you can use any ITK filter <BR>&gt; afterwards.<BR>&gt; Regards,<BR>&gt; Xabi<BR>&gt; <BR>&gt; -- <BR>&gt; Xabier Artaechevarria<BR>&gt; Cancer Imaging Laboratory<BR>&gt; Centre for Applied Medical Research<BR>&gt; www.cima.es<BR>&gt; <BR>&gt; <BR>&gt; <BR>&gt; Manuel David Tabas Calle &lt;manueldavid.tabas@hotmail.es&gt; ha escrito:<BR>&gt; <BR>&gt; &gt;<BR>&gt; &gt; Thank you Xabier, I´ll try to use wath you told me.<BR>&gt; &gt;<BR>&gt; &gt; Now I have another cuestion. If the raw image that I have is a 3D <BR>&gt; &gt; image (in fact tha image is a set of 40 raw images put one after <BR>&gt; &gt; other) and I write a MetaImage or I use itk::RawImageIO, can i use <BR>&gt; &gt; it with a 3D trasform method to register two 3D images? I mean, can <BR>&gt; &gt; I used this image directly with VersorRigid3DTransform, for example, <BR>&gt; &gt; and ITK will handle correctly the image?<BR>&gt; &gt;<BR>&gt; &gt; Thank you all.<BR>&gt; &gt;&gt; Date: Wed, 22 Oct 2008 08:36:21 +0200&gt; From: xabiarta@unav.es&gt; To: <BR>&gt; &gt;&gt; insight-users@itk.org&gt; Subject: Re: [Insight-users] 3D registration <BR>&gt; &gt;&gt; problem&gt; &gt; Hi Manuel,&gt; &gt; You are right. You can read raw images <BR>&gt; &gt;&gt; directly. You a few different options:&gt; &gt; 1. Convert images to <BR>&gt; &gt;&gt; another format, using some other program, for &gt; instance ImageJ.&gt; <BR>&gt; &gt;&gt; 2. Use the itk::RawImageIO class to read the images. You will need <BR>&gt; &gt;&gt; &gt; to set the size, pixel type, etc. yourself.&gt; 3. Use the mhd <BR>&gt; &gt;&gt; format. You need to add a header file. Look for the &gt; sub-header: <BR>&gt; &gt;&gt; "Writing a MetaImage header for raw data" in&gt; <BR>&gt; &gt;&gt; http://www.itk.org/HTML/Data.htm.&gt; &gt; I would go for options 1 or 3 <BR>&gt; &gt;&gt; for simplicity, but it is up to you.&gt; Best regards,&gt; Xabi&gt; &gt; --&gt; <BR>&gt; &gt;&gt; Xabier Artaechevarria&gt; Cancer Imaging Laboratory&gt; Centre for <BR>&gt; &gt;&gt; Applied Medical Research&gt; www.cima.es&gt; &gt; &gt; &gt; Manuel David Tabas <BR>&gt; &gt;&gt; Calle &lt;manueldavid.tabas@hotmail.es&gt; ha escrito:&gt; &gt; &gt;&gt; &gt; Hi!&gt; &gt;&gt; &gt; <BR>&gt; &gt;&gt; I´m trying to register raw 2D images but i don´t really know how to <BR>&gt; &gt;&gt; do.&gt; &gt;&gt; &gt; With 2D images in png, for example, there are no problem <BR>&gt; &gt;&gt; using the &gt; &gt; examples and following the ITKSoftwareGuide with <BR>&gt; &gt;&gt; images in png, for &gt; &gt; example, but when i try to use raw images <BR>&gt; &gt;&gt; for the register, the &gt; &gt; program can´t red them. Is that problem <BR>&gt; &gt;&gt; caused by the fact that the &gt; &gt; raw images have not a header with <BR>&gt; &gt;&gt; the dimensions??? If that, how can &gt; &gt; i fix it???&gt; &gt;&gt; &gt; Thak you <BR>&gt; &gt;&gt; all.&gt; &gt; <BR>&gt; &gt;&gt; _________________________________________________________________&gt; <BR>&gt; &gt;&gt; &gt; ¿Sigue el calor? Consulta MSN El tiempo&gt; &gt; <BR>&gt; &gt;&gt; http://eltiempo.es.msn.com/&gt; &gt; &gt; &gt; <BR>&gt; &gt;&gt; ----------------------------------------------------------------&gt; <BR>&gt; &gt;&gt; Este mensaje ha sido enviado desde https://webmail.unav.es&gt; &gt; <BR>&gt; &gt;&gt; _______________________________________________&gt; Insight-users <BR>&gt; &gt;&gt; mailing list&gt; Insight-users@itk.org&gt; <BR>&gt; &gt;&gt; http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users<BR>&gt; &gt; _________________________________________________________________<BR>&gt; &gt; ¡Entra en el Club oficial de Messenger y te enterarás de todas las novedades!<BR>&gt; &gt; http://www.vivelive.com/ilovemessenger<BR>&gt; <BR>&gt; <BR>&gt; <BR>&gt; ----------------------------------------------------------------<BR>&gt; Este mensaje ha sido enviado desde https://webmail.unav.es<BR>&gt; <BR>&gt; _______________________________________________<BR>&gt; Insight-users mailing list<BR>&gt; Insight-users@itk.org<BR>&gt; http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users<BR><BR><br /><hr />Juega a las preguntas de Live Quiz con tus contactos de Messenger <a href='http://www.vivelive.com/LiveQuiz/' target='_new'>¡Empieza ahora!</a></body>
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