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Hi, Luis,<div><br></div><div>Thank you very much for your suggestions and I will check all those&nbsp;</div><div>factors. I will get back to you later.</div><div><br></div><div>Would you mind explain the difference between two optimizers:&nbsp;</div><div>itkRegularStepGradientDescentOptimizer</div><div>itkLBFGSBOptimizer<br></div><div><br></div><div>Thanks.</div><div><br></div><div>Sean</div><div><br><br>&gt; Date: Fri, 10 Jul 2009 10:34:28 -0400<br>&gt; From: luis.ibanez@kitware.com<br>&gt; To: kevinseanlee@live.com<br>&gt; CC: insight-users@itk.org<br>&gt; Subject: Re: [Insight-users] problems on deformable registration 8<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; Hi Sean,<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; I'm wondering if this could be an aliasing effect<br>&gt; between the BSpline grid and the grid of your image.<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; But other suspects are:<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt;     1) and Interpolator issue in the border<br>&gt; <br>&gt;     2) an issue with the Optimizer<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; Please do the following:<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt;     Pass your images as input to<br>&gt; <br>&gt;       DeformableRegistration15.cxx<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt;     This program uses a different Optimizer.<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt;     That may help to eliminate (2) above.<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; If things still fail....<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; Then we will ask you to send your images to us.<br>&gt; So we can try to replicate the problem here.<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; <br>&gt;     Thanks<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt;        Luis<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; --------------------<br>&gt; Sean Lee wrote:<br>&gt; &gt; Hi, Luis,<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; I found that another parameter could affect the result. If I <br>&gt; &gt; change gridSizeOnImage.Fill( 8 ) to <br>&gt; &gt; gridSizeOnImage.Fill( 10 ), it could result in the case with 59 slices <br>&gt; &gt; that used to run 34 iterations <br>&gt; &gt; only run one iteration.<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; So it is really depending on the parameters you input.<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; Thanks.<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; Sean<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; ------------------------------------------------------------------------<br>&gt; &gt; From: kevinseanlee@live.com<br>&gt; &gt; To: luis.ibanez@kitware.com<br>&gt; &gt; Date: Thu, 9 Jul 2009 12:53:39 -0500<br>&gt; &gt; CC: insight-users@itk.org<br>&gt; &gt; Subject: Re: [Insight-users] problems on deformable registration 8<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; Hi, Luis,<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; I am trying to provide more information and tested it with several other <br>&gt; &gt; numbers. Here is the results.<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; 29, 56, 57, 58, 60 slices: 1 iteration with a bad result.<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; 30 slices; 45 iterations with a good result. (of course, only half <br>&gt; &gt; volume is matched)<br>&gt; &gt; 59 slices; 34 iterations with a good result.<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; Let me know what I can do for this issue.<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; Thanks.<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; Sean<br>&gt; &gt; <br></div><br /><hr />Windows Live™ SkyDrive™: Get 25 GB of free online storage.   <a href='http://windowslive.com/online/skydrive?ocid=TXT_TAGLM_WL_SD_25GB_062009' target='_new'>Get it on your BlackBerry or iPhone.</a></body>
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