<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META content="text/html; charset=iso-2022-jp" http-equiv=Content-Type>
<META name=GENERATOR content="MSHTML 8.00.6001.18812"></HEAD>
<BODY>
<DIV dir=ltr align=left>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial>Dear 
list-subscribers,</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 
face=Arial></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT face=Arial><FONT color=#0000ff><FONT 
size=2>We are proud to announce a new release of elastix: elastix 4.2 
!</FONT></FONT></FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 
face=Arial></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><SPAN class=343342415-18082009><FONT 
face=Arial><FONT color=#0000ff size=2>Elastix is a software package for image 
registration, based on the ITK. The software consists of a collection of 
algorithms that are commonly used to solve medical image registration problems. 
The modular design of elastix allows the user to quickly configure, test, and 
compare different registration methods for a specific application. In addition 
to the existing ITK image registration classes, elastix implements new 
functionality. The most important enhancements 
are</FONT></FONT></SPAN></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><SPAN 
class=343342415-18082009></SPAN></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><SPAN 
class=343342415-18082009></SPAN></SPAN><SPAN class=250084514-18082009><SPAN 
class=343342415-18082009><FONT face=Arial><FONT color=#0000ff><FONT size=2>- A 
modular framework for sampling 
strategies.</FONT></FONT></FONT></SPAN></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><SPAN class=343342415-18082009><FONT 
color=#0000ff size=2 face=Arial>-&nbsp;More optimisers: Kiefer-Wolfowitz, 
Robbins-Monro, adaptive </FONT></SPAN></SPAN><SPAN 
class=250084514-18082009><SPAN class=343342415-18082009><FONT color=#0000ff 
size=2 face=Arial>stochastic gradient descent, evolutionary 
strategy.</FONT></SPAN></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><SPAN class=343342415-18082009><FONT 
color=#0000ff size=2 face=Arial>- Complete rework of existing ITK optimisers, 
adding more user control </FONT></SPAN></SPAN><SPAN 
class=250084514-18082009><SPAN class=343342415-18082009><FONT color=#0000ff 
size=2 face=Arial>and better error handling: quasi-Newton, nonlinear conjugate 
gradient.</FONT></SPAN></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><SPAN class=343342415-18082009><FONT 
color=#0000ff size=2 face=Arial>-&nbsp;</FONT></SPAN></SPAN><SPAN 
class=250084514-18082009><SPAN class=343342415-18082009><FONT color=#0000ff 
size=2 face=Arial>Several new or more flexible cost functions: (normalised) 
mutual </FONT><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial>information, implemented 
with Parzen windowing similar to [45], multifeature </FONT><FONT color=#0000ff 
size=2 face=Arial>$B&A(B-mutual information, bending energy penalty term, rigidity 
</FONT><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial>penalty 
term.</FONT></SPAN></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><SPAN class=343342415-18082009><FONT 
face=Arial><FONT color=#0000ff size=2>- The ability to concatenate any number of 
geometric transformations.</FONT></FONT></SPAN></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><SPAN class=343342415-18082009><FONT 
face=Arial><FONT color=#0000ff size=2>- The transformations support computation 
of not only $B"_(BT/$B"_&L(B, but also </FONT></FONT><FONT color=#0000ff size=2 
face=Arial>of spatial derivatives $B"_(BT/$B"_(Bx and $B"_(B2T/$B"_(Bx2, and their derivatives to 
</FONT><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial>$B&L(B, frequently required for the 
computation of regularisation terms. Additionally, </FONT><FONT color=#0000ff 
size=2 face=Arial>the compact support of certain transformations is integrated 
</FONT><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial>more 
generally.</FONT></SPAN></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><SPAN class=343342415-18082009><FONT 
face=Arial><FONT color=#0000ff size=2>- Linear combinations of cost functions, 
instead of just a single cost </FONT></FONT><FONT color=#0000ff size=2 
face=Arial>function.</FONT></SPAN></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><SPAN class=343342415-18082009><FONT 
color=#0000ff size=2 face=Arial></FONT></SPAN></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial><FONT color=#0000ff><FONT size=2><SPAN 
class=250084514-18082009><SPAN 
class=343342415-18082009>&nbsp;</SPAN></SPAN><SPAN 
class=250084514-18082009>Elastix can be downloaded<SPAN 
class=343342415-18082009>&nbsp;</SPAN>from the website<SPAN 
class=343342415-18082009>, under the very open BSD license, 
see</SPAN>:</SPAN></FONT></FONT></FONT></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 
face=Arial></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 
face=Arial>&nbsp;&nbsp;&nbsp; </FONT><A href="http://elastix.isi.uu.nl/"><FONT 
size=2 face=Arial>http://elastix.isi.uu.nl/</FONT></A></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 
face=Arial></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial>We 
have updated quite some components in this new release<SPAN 
class=343342415-18082009> compared to elastix 4.1</SPAN>, and also added a few. 
The most important changes are:</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 
face=Arial></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial>- The 
implementation of spatial derivatives in all transform classes. This enables the 
computation of many regularisation (penalty) terms in a general 
way.</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 
face=Arial>-&nbsp;A general&nbsp;way of dealing with sparse Jacobians, so 
that&nbsp;for example much less&nbsp;B-spline specific code is needed 
anymore.</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial>- The 
adaptive stochastic gradient descent (ASGD) optimization routine is now usable 
for much larger registration problems. (It used to crash when the number of 
parameters was larger than 10 000.)</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial>- We 
added the following components:&nbsp;WeightedCombinationTransform, 
SplineKernelTransform (which implements a ThinPlateSpline, ElasticBodySpline, 
VolumeSpline, and an ElasticBodyReciprocalSpline), TransformRigidityPenalty, 
TransformBendingEnergyPenalty, DisplacementMagnitudePenalty.</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 
face=Arial></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial>A more 
complete list of changes can be found at the website:</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 
face=Arial></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT face=Arial><FONT color=#0000ff><FONT 
size=2>&nbsp;&nbsp;&nbsp; </FONT><A 
href="http://elastix.isi.uu.nl/whatsnew_04_2.php"><FONT 
size=2>http://elastix.isi.uu.nl/whatsnew_04_2.php</FONT></A></FONT></FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 
face=Arial></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial>If you 
find any bugs or have comments on this new release, please contact us through 
the mailinglist:</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 
face=Arial></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT face=Arial><FONT color=#0000ff><FONT 
size=2>&nbsp;&nbsp;&nbsp; </FONT><A href="mailto:elastix@bigr.nl"><FONT 
size=2>elastix@bigr.nl</FONT></A></FONT></FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 
face=Arial></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial>We are 
also looking for a volunteer to build MacOSX binaries for us, so we can place 
them on the website.</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 
face=Arial></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 face=Arial>Enjoy 
elastix!</FONT></SPAN></DIV>
<DIV><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff size=2 
face=Arial></FONT></SPAN>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff><FONT 
size=2>Stefan Klein and Marius Staring<SPAN 
class=343342415-18082009>&nbsp;</SPAN></FONT></FONT></SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial><SPAN class=250084514-18082009><FONT color=#0000ff><FONT 
size=2><SPAN 
class=343342415-18082009>&nbsp;</SPAN></FONT></FONT></SPAN></FONT></DIV></DIV></BODY></HTML>