Thank you, Luis.<br><br>Thanks,<br>john<br><br><div class="gmail_quote">On Sun, Oct 25, 2009 at 6:20 PM, Luis Ibanez <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:luis.ibanez@kitware.com">luis.ibanez@kitware.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">Hi John,<br>
<br>
Yes, you will need to use a multi-modality metric.<br>
<br>
Note as well, that in order to register PET and MRI<br>
images, you may want to focus on the range of PET<br>
intensities that reveal anatomical features that are<br>
also visible in the MRI scan.<br>
<br>
That is, usually you want to use, mostly, the low<br>
intensity levels of the PET image. One way of<br>
achieving this is to pass the PET image through<br>
a filter that applies an intensity transformation.<br>
<br>
You could do this with any of the following:<br>
<br>
  a) SigmoidImageFilter<br>
  b) IntensityWindowingImageFilter<br>
<br>
<br>
Then you use the converted image as the<br>
input for the image registration process<br>
along with the MRI image.<br>
<br>
<br>
Regards,<br>
<br>
<br>
       Luis<br>
<br>
<br>
-------------------------------------------------------<br>
<div class="im">On Sun, Oct 25, 2009 at 5:14 AM, John Drozd &lt;<a href="mailto:john.drozd@gmail.com">john.drozd@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>
</div><div><div></div><div class="h5">&gt; Hi,<br>
&gt;<br>
&gt; What would be the best approach to register PET and MR images using ITK?<br>
&gt; My feeling is that I would use a multi-modal registration algorithm.<br>
&gt;<br>
&gt; Thanks,<br>
&gt; john<br>
&gt;<br>
&gt; --<br>
&gt; John Drozd<br>
&gt; Postdoctoral Fellow<br>
&gt; Imaging Research Laboratories<br>
&gt; Robarts Research Institute<br>
&gt; Room 1256<br>
&gt; 100 Perth Drive<br>
&gt; London, Ontario, Canada<br>
&gt; N6A 5K8<br>
&gt; (519) 661-2111 ext. 25306<br>
&gt;<br>
</div></div><div><div></div><div class="h5">&gt; _____________________________________<br>
&gt; Powered by <a href="http://www.kitware.com" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
&gt;<br>
&gt; Visit other Kitware open-source projects at<br>
&gt; <a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
&gt;<br>
&gt; Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
&gt; <a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br>
&gt;<br>
&gt; Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
&gt; <a href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users" target="_blank">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users</a><br>
&gt;<br>
&gt;<br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>John Drozd<br>Postdoctoral Fellow<br>Imaging Research Laboratories<br>Robarts Research Institute<br>Room 1256<br>100 Perth Drive<br>London, Ontario, Canada<br>
N6A 5K8<br>(519) 661-2111 ext. 25306<br>