<br>Hi Sarah,<br><br>You may want to try the same filters that are used for correcting <br>for MRI intensity inhomogeneity.<br><br>See the directory:<br>InsightApplications/MRIBiasCorrection<br><br>These classes approximate the illumination distribution with a <br>
polynomial, and then use the polynomial in order to normalize<br>the intensity across space.<br><br>You may also find useful the following paper of the Insight Journal:<br><br>&quot;N4ITK:  Nick&#39;s N3 ITK Implementation For MRI Bias Field Correction&quot;<div class="authors">
Tustison N., Gee J.</div>
<div class="institution">PICSL, University of Pennsylvania<br><br></div><a href="http://www.insight-journal.org/browse/publication/640">http://www.insight-journal.org/browse/publication/640</a><br><br><a href="http://hdl.handle.net/10380/3053">http://hdl.handle.net/10380/3053</a><br>
<br><br><br>     Regards,<br><br><br>             Luis<br><br><br>----------------------------------------------------------------------------<br><div class="gmail_quote">On Wed, Nov 4, 2009 at 5:28 PM, Sarah Waldron <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:sarah.waldron11@yahoo.com">sarah.waldron11@yahoo.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;"><table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0"><tbody><tr><td style="font-family: inherit; font-style: inherit; font-variant: inherit; font-weight: inherit; font-size: inherit; line-height: inherit; font-size-adjust: inherit; font-stretch: inherit;" valign="top">
<div>Hi,</div>
<div>I&#39;m new to ITK. I have a series of brain images taken with a camera that when combined are supposed to form a 3 dimensional volume. The camera had a flash and the slices don&#39;t all have the same lighting and shadowing effects. Does anyone have any suggestions how to correct this so that all the images have the same light distribution?</div>

<div>Thanks,</div>
<div>Sarah</div></td></tr></tbody></table><font color="#888888"><br>



      </font><br>_____________________________________<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at<br>
<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
<a href="http://www.kitware.com/products/protraining.html" target="_blank">http://www.kitware.com/products/protraining.html</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
<a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users" target="_blank">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users</a><br>
<br></blockquote></div><br>