Thanks Brad, we will give it a try!<br><br>Regards<br><br>Iván<br><br><br><div class="gmail_quote">El 19 de noviembre de 2009 16:04, Bradley Lowekamp <span dir="ltr"><<a href="mailto:blowekamp@mail.nih.gov">blowekamp@mail.nih.gov</a>></span> escribió:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;"><div style="word-wrap: break-word;">Hello,<div><br></div><div>You should look at the Statistics in the Review directory. It should take care of this problem. It is enabled by turning on a CMake flag during the building ok ITK.</div>
<div><br></div><div>Enjoy,</div><div>Brad<br><div><br><div><div><div></div><div class="h5"><div>On Nov 17, 2009, at 6:18 AM, Iván Macía wrote:</div><br></div></div><blockquote type="cite"><span style="border-collapse: separate; font-family: Helvetica; font-size: medium; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px;"><div link="blue" vlink="purple" lang="ES">
<div><div></div><div class="h5"><div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;">Dear all,</div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;">
</div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"><span lang="EN-US">We have been experiencing problems with our software when moving to the latest versión of ITK (3.16). The problem seems to be that, when calculating the histogram of the volume, now itk::Statistics::DenseFrequencyContainer throws an exception. This case is very common, since most of the 3D CT images have voxels whose background value (16777216).</span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"><span lang="EN-US"> </span></div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"><span lang="EN-US">It was our problem not to catch that exception, but even if we catch it, I don’t see why the saturation of the histogram should interrupt the calculation, breaking the call stack, only because the background values, which are not very interesting for us, saturate the histogram.</span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"><span lang="EN-US"> </span></div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"><span lang="EN-US">I think the solution is to change the type for the total frequency of the container in order to have more capacity, since 3D images tend to be larger and larger and that number seems to be insufficient.</span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"><span lang="EN-US"> </span></div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"><span lang="EN-US">What do you think?</span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"><span lang="EN-US"> </span></div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"><span lang="EN-US">Thanks in advance</span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"><span lang="EN-US"> </span></div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"><span lang="EN-US">Iván</span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"><span lang="EN-US"> </span></div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;">_______________________________________________________</div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;">Iván Macía Oliver</div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;">Investigador / Researcher</div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;">eSalud & Aplicaciones Biomédicas / eHealth & Biomedical Applications</div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;">
</div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;">Vicomtech - Visual Interaction Communication Technologies</div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;">
Mikeletegi Pasealekua, 57 - Parque Tecnológico</div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;">20009 Donostia - San Sebastián - Spain</div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;">
<span lang="EN-US">Tel: +[34] 943 30 92 30</span></div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"><span lang="EN-US">Fax: +[34] 943 30 93 93</span></div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;">
<span lang="EN-US">e-mail:<span> </span><a href="mailto:imacia@vicomtech.org" style="color: blue; text-decoration: underline;" target="_blank">imacia@vicomtech.org</a></span></div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;">
<span lang="EN-US"><a href="http://www.vicomtech.org" style="color: blue; text-decoration: underline;" target="_blank">http://www.vicomtech.org</a></span></div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;">
<span lang="EN-US"> </span></div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"><span lang="EN-US">*** member of INI-GraphicsNet ****</span></div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;">
<span lang="EN-US"><a href="http://www.inigraphics.net" style="color: blue; text-decoration: underline;" target="_blank">www.inigraphics.net</a></span></div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;">
<span lang="EN-US">*** member of IK4 Research Alliance ****</span></div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"><span lang="EN-US"><a href="http://www.ik4.es" style="color: blue; text-decoration: underline;" target="_blank">www.ik4.es</a></span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"><span lang="EN-US"> </span></div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"><span lang="EN-US">----------------------------------------------------------</span></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"><span lang="EN-US">Vicomtech is an ISO 9001:2000 certified institute</span></div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;">
----------------------------------------------------------</div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"> </div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;">
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<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"> </div><div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri,sans-serif;"> </div></div></div></div><span><ATT00001..txt></span></div>
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