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Hello,<br><br>Just a word to say that using this pipeline<br><br>RegionOfInterestImageFilter<br>MedianImageFilter<br>PasteImageFilter<br><br>it works, I mean I quickly tried and I got a good visual result (only the part I chossed has been filtred) <br><br>Thanks,<br>Steve<br><br>&gt; From: imacia@vicomtech.org<br>&gt; To: luis.ibanez@kitware.com; steve.harris18@hotmail.com<br>&gt; CC: insight-users@itk.org<br>&gt; Subject: RE: [Insight-users] Apply filter only on a specific region ?<br>&gt; Date: Mon, 25 Jan 2010 18:15:20 +0100<br>&gt; <br>&gt; Hi Luis,<br>&gt; <br>&gt; Just a question. We were discussing here at work the meaning of the<br>&gt; different regions (Largest vs Requested vs Buffered). One question we had is<br>&gt; if you can process a part of the image only by setting the Requested Region<br>&gt; on the output, which seems quite straightforward and compatible with the ITK<br>&gt; pipeline definition. What would you get here? An image whose Largest<br>&gt; Possible Region is the same as the one you requested?<br>&gt; <br>&gt; The idea I have is that the Requested Region is an important part of the ITK<br>&gt; pipeline and is used by the filters, at least internally, so why is its use<br>&gt; discouraged in this case?<br>&gt; <br>&gt; Thanks in advance<br>&gt; <br>&gt; Iván<br>&gt; <br>&gt; PD: it is common the case in which we have to process only a certain part of<br>&gt; the image in medical applications, for example when we have to calculate<br>&gt; statistics in a region of interest from a 3D image, as defined by the<br>&gt; radiologist. It may be inconsistent from the point of view image processing<br>&gt; but it works :) This is just an example but we have find many cases in which<br>&gt; we have had to restrict ourselves only to a certain part of the image as<br>&gt; defined by the user, due to memory limitations or for a faster processing<br>&gt; among other reasons.<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; -----Mensaje original-----<br>&gt; De: insight-users-bounces@itk.org [mailto:insight-users-bounces@itk.org] En<br>&gt; nombre de Luis Ibanez<br>&gt; Enviado el: domingo, 24 de enero de 2010 16:11<br>&gt; Para: dsdfdff sfdsf<br>&gt; CC: insight-users@itk.org<br>&gt; Asunto: Re: [Insight-users] Apply filter only on a specific region ?<br>&gt; <br>&gt; Hi Steve,<br>&gt; <br>&gt; It depends....<br>&gt; <br>&gt; What exactly do you want at the output ?<br>&gt; <br>&gt; A) The full input input with the subregion modified ?<br>&gt; <br>&gt; or<br>&gt; <br>&gt; B) only the modified subregion ?<br>&gt; <br>&gt; ---<br>&gt; <br>&gt; If you want (A) you will have to use a pipeline<br>&gt; such as:<br>&gt; <br>&gt; RegionOfInterestImageFilter<br>&gt; MedianImageFilter<br>&gt; PasteImageFilter<br>&gt; <br>&gt; If you want (B) you could use simply<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; RegionOfInterestImageFilter<br>&gt; MedianImageFilter<br>&gt; <br>&gt; or even use the SetRequrestedRegion()<br>&gt; of the Median filter directly.  Although<br>&gt; this last option is not a recommended<br>&gt; practice, unless you are very familiar<br>&gt; with the inner-workings of the ITK pipeline.<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; --<br>&gt; <br>&gt; On a side note:<br>&gt; <br>&gt; Why do you want to do such thing ?    :-)<br>&gt; <br>&gt; From the pure image processing point of view,<br>&gt; it doesn't seem to be a good operation. You<br>&gt; will end up with an inconsistent image...<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; <br>&gt;      Regards,<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt;             Luis<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; --------------------------------------<br>&gt; On Fri, Jan 22, 2010 at 5:51 AM, dsdfdff sfdsf<br>&gt; &lt;steve.harris18@hotmail.com&gt; wrote:<br>&gt; &gt; Hello itk user,<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; I was wondering if it was possible to apply a filter only on a specific<br>&gt; &gt; region of an image (like setting a bundary region)?<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; for example if I have a simple 3D image (let say 30x30x30) is it possible<br>&gt; &gt; for example to apply the mean filter<br>&gt; &gt; only on the region (15x15x15)?<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; regards,<br>&gt; &gt; Steve<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; ________________________________<br>&gt; &gt; Faites une bonne action avec Bing Solidaire ! C'est ici !<br>&gt; &gt; _____________________________________<br>&gt; &gt; Powered by www.kitware.com<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; Visit other Kitware open-source projects at<br>&gt; &gt; http://www.kitware.com/opensource/opensource.html<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>&gt; &gt; http://www.kitware.com/products/protraining.html<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>&gt; &gt; http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>&gt; &gt; http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt;<br>&gt; _____________________________________<br>&gt; Powered by www.kitware.com<br>&gt; <br>&gt;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