Hi Luis,<br><br>Thank you. I&#39;ll try this and let you know of my progress.<br><br>thanks,<br>John<br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Apr 27, 2010 at 11:58 PM, Luis Ibanez <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:luis.ibanez@kitware.com">luis.ibanez@kitware.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;"><br>Hi John,<br><br>If you are looking for a way of characterizing the <br>registration method itself, then you may want to<br>
consider doing the following:<br><br>1) Take an image representative of your domain.<br><br>2) Apply to it a known deformation<br>
<br>3) Use the image (1) as moving image and the <br>    image (2) as fixed image<br><br>4) Compare the deformation field resulting from<br>    the registration (3) with the known field that<br>    you used in (2). The differences between the<br>

    fields will give you an idea of the accuracy <br>    of the registration.<br><br>For step (2), you may find useful the examples<br><br>       Insight/Examples/Registration/<br>                      BSplineWarping1.cxx<br>

                      BSplineWarping2.cxx<br>                      LandmarkWarping2.cxx<br>                      ThinPlateSplineWarp.cxx<br>                    <br><br>Please be very careful of avoiding generalizations.<br>

Registration results are very dependent on the setting <br>of parameters.  Whatever measure of accuracy you<br>obtain, will only be representative of that registration<br>method WITH those exact parameters.  <br><br>You should therefore, repeat the entire process for <br>

a variety of parameters, and report on all the sequence.<br><br>It is a common mistake to report registration results<br>by just using a setting of parameters. This is mostly <br>seen in conferences and journals that do not enforce<br>

or encourage reproducibility (sadly most of them).<br><br><br>      Regards,<br><br><br>            Luis<br><br><br>----------------------------------------------------------------------<br><div class="gmail_quote"><div>
<div></div><div class="h5">On Mon, Apr 26, 2010 at 6:30 PM, John Jan Drozd <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:john.drozd@gmail.com" target="_blank">john.drozd@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
</div></div><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;"><div><div></div><div class="h5">Hi,<br>
<br>
Is there a way to quantify the accuracy of a deformable registration? I used the diffeomorphic demons deformable registration.<br>
<br>
Thank you,<br>
John<br>
<br>
Sent from my iPhone<br></div></div><div class="im">
_____________________________________<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at<br>
<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
<a href="http://www.kitware.com/products/protraining.html" target="_blank">http://www.kitware.com/products/protraining.html</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
<a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users" target="_blank">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users</a><br>
</div></blockquote></div><br>
</blockquote></div><br>