<html>
<head>
<style><!--
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 10pt;
font-family:Verdana
}
--></style>
</head>
<body class='hmmessage'>
The problem with the approach in the paper is that RT structure contours can have arbitrary resolution.<BR><BR>Xiaofeng<BR><BR><BR><BR>&nbsp;<BR>
<HR id=stopSpelling>
From: Jason.Dowling@csiro.au<BR>To: xf10036@hotmail.com<BR>CC: insight-users@itk.org<BR>Date: Wed, 5 May 2010 10:06:03 +1000<BR>Subject: Re: Creating an approximate cross-section of a RT<BR><BR>
<STYLE>
.ExternalClass p.ecxMsoNormal, .ExternalClass li.ecxMsoNormal, .ExternalClass div.ecxMsoNormal
{margin-bottom:.0001pt;font-size:12.0pt;font-family:'Times New Roman';}
.ExternalClass a:link, .ExternalClass span.ecxMsoHyperlink
{color:blue;text-decoration:underline;}
.ExternalClass a:visited, .ExternalClass span.ecxMsoHyperlinkFollowed
{color:purple;text-decoration:underline;}
.ExternalClass p.ecxMsoPlainText, .ExternalClass li.ecxMsoPlainText, .ExternalClass div.ecxMsoPlainText
{margin-bottom:.0001pt;font-size:10.0pt;font-family:'Courier New';}
.ExternalClass span.ecxEmailStyle17
{font-family:Arial;color:windowtext;}
@page Section1
{size:595.3pt 841.9pt;}
.ExternalClass div.ecxSection1
{page:Section1;}
</STYLE>

<DIV class=ecxSection1>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face=Arial size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial">Hi </SPAN></FONT><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">Xiaofeng, </SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">You can use the code from this Insight Journal paper: <A href="http://www.insight-journal.org/browse/publication/701">http://www.insight-journal.org/browse/publication/701</A> to read the DICOM-RT structures into a binary volume.&nbsp; An easy way to then visualize the different orientations of the ROI is to load it into ITK-SNAP ( <A href="http://www.itksnap.org/pmwiki/pmwiki.php">http://www.itksnap.org/pmwiki/pmwiki.php</A> ).&nbsp; </SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">Cheers,</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">Jason</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face=Arial size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face=Arial size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face=Arial size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<DIV>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Times New Roman" size=3><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Times New Roman" size=3><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt">-----</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">&nbsp;</SPAN></FONT></P></DIV>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">All,</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">I've post this in VTK board but I didn't get the answer.&nbsp; Before I set</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">out to implement it, I'll post it here.</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">I have a set of contours in axial orientation representing a ROI. I</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">need to sketch the ROI in coronal and sagittal plane, by connection the</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">points made from the intersection of the contours and the cutting plane.</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">Is there a function to do that in vtk or in ITK?</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">Some in VTK board suggested constructing a surface and create</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">the crosssection by cutting the surface.&nbsp; But that is not what I need.</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">I need to do it in the rudimentary way for performance.</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">&nbsp;Many thanks!</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">Xiaofeng</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Courier New" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: 'Courier New'">&nbsp;</SPAN></FONT></P>
<P class=ecxMsoNormal><FONT face="Times New Roman" size=3><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt">&nbsp;</SPAN></FONT></P></DIV>                                               <br /><hr />The New Busy is not the old busy. Search, chat and e-mail from your inbox. <a href='http://www.windowslive.com/campaign/thenewbusy?ocid=PID28326::T:WLMTAGL:ON:WL:en-US:WM_HMP:042010_3' target='_new'>Get started.</a></body>
</html>