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<br>When i work with images of brain which hardly has any non-rigid component in it, i use affine transformation. However, most of the other organs need non-rigid transform and hence we use non-rigid transform for the whole image. If there are regions that undergoes only a rigid transform, the resulting deformation field should confirm that. <br><br>Is it possible for you to crop the image into 2 regions - one that can undergo only rigid transform and another that has all the degrees of freedom to transform? That way, you would have absolute assurance that the rigid organ has a rigid deformation field.<br><br>my 2 cents...<br>Ganesh<br><br><font style="" color="#1f497d" face="Verdana">************************************************************************</font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana"><br></font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana">
"What the mind of man can conceive and believe, It can achieve" - </font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana"><span class="ecxil">Napolean</span></font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana"> </font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana"><span class="ecxil">Hill</span></font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana"><br></font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana">
-Ganesh 
Narayanasamy,Ph.D., PostDoc-University of Kentucky Cancer Center</font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana"><br></font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana">
Earlier work: 
http://www.sciencedaily.com/releases/2007/05/070504133017.htm</font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana"><br></font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana">
************************************************************************</font><br><br>&gt; Date: Thu, 6 May 2010 09:19:48 +1000<br>&gt; From: Xi Liang &lt;liangxi1986317@hotmail.com&gt;<br>&gt; Subject: Re: [Insight-users] modify deformation field<br>&gt; <br>&gt; Thank you for your suggestion, but I think I did not make myself clear in<br>&gt; the last question. I was trying to modify the deformation field itself (not<br>&gt; moving image) to enforce a certain set of the deformation field is equal to<br>&gt; a rigid transformation. The set of deformation field need to modify is find<br>&gt; from a mask in the moving image.<br>&gt; <br>&gt; The motivation is, the original deformation field is a nonrigid deformation,<br>&gt; however, I would like to apply it on a image that only certain part of the<br>&gt; image is nonrigid. Thus I will have to modify the deformation field to allow<br>&gt; only rigid deformation applied on the rigid structure of the image,<br>&gt; and nonrigid deformation on the nonrigid structures. I hope this make sense.<br>&gt; <br>&gt; That was the question I want to ask. However, later I realized that<br>&gt; modifying the deformation field might not be the right way to enforce the<br>&gt; rigid deformation. Instead, the better way is to modify the control point<br>&gt; parameters (Bspline transformation) to enforce the rigid transformation,<br>&gt; based on Tanner's paper in 2000. I post a question on this in another post.<br>&gt; <br><br>                                               <br /><hr />The New Busy think 9 to 5 is a cute idea. Combine multiple calendars with Hotmail.  <a href='http://www.windowslive.com/campaign/thenewbusy?tile=multicalendar&ocid=PID28326::T:WLMTAGL:ON:WL:en-US:WM_HMP:042010_5' target='_new'>Get busy.</a></body>
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