<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;"><span class="Apple-style-span" style="font-family: 'Times New Roman'; font-size: medium; "><pre>Dear H. B.,</pre><pre><br></pre><pre>Basically there are four types of segmentation methods available in</pre><pre><br></pre><pre>ITK which are morphological, level-set, deformable and hybrid&nbsp;</pre><pre><br></pre><pre>segmentation methods. I completely agree with Jon, the ITK software&nbsp;</pre><pre><br></pre><pre>guide is a comprehensive source for learning about these different&nbsp;</pre><pre><br></pre><pre>methods but considering your application (image guided surgery with&nbsp;</pre><pre><br></pre><pre>FEM) any of the level-set methods seem suitable (e.g. Canny-Edge&nbsp;</pre><pre><br></pre><pre>Level Set Segmentation). These methods would give you a good control</pre><pre><br></pre><pre> over your resulting images since they are parametric
 approaches.&nbsp;</pre><pre><br></pre><pre>Another good resource for learning more about segmentation methods&nbsp;</pre><pre><br></pre><pre>is the book "image Processing, Analysis,&nbsp;and Computer Vision" by&nbsp;</pre><pre><br></pre><pre>Milan Sonka et al., chapter 7 of the book is about different&nbsp;</pre><pre><br></pre><pre>segmentation methods.</pre><pre><br></pre><pre>Regards,</pre><pre><br></pre><pre>Dawood Masslawi</pre><pre><br></pre><pre>&gt;Hi all,</pre><pre>&gt;&nbsp;
&gt;Is there&nbsp;a good atomatic segmentation tool, that i give it set of images and the output is set of segmented images.
&gt;&nbsp;
&gt;Best Regards
&gt;&nbsp;&nbsp; H.B</pre></span></td></tr></table><br>