<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body text="#000000" bgcolor="#ffffff">
    <font face="Helvetica, Arial, sans-serif">Hi there,<br>
      reading Dawood's mail I just realized that I (possibly we) forgot
      to make some little but important comments on the issue.<br>
      <br>
      IMHO, there are (at least) three main difficulties when
      developping a segmentation method and/or using an already
      implemented segmentation method:<br>
      <br>
      1. Good parametrization. A good selection of the parameters is
      crucial for the method.<br>
      <br>
      2. The parameters' value is highly dependent on the image type and
      region to be segmented. Sometimes some compromise values work, but
      trial and error is usually necessary to find the appropriate range
      of values for your application.<br>
      <br>
      3. Automatization of the method. Automating the segmentation
      process is by no means a trivial task; it may well happen that you
      are not able to achieve a fully automated method (in fact,
      automatic segmentation is a recurrent topic in medical image
      processing); if the method performs well, a minimal user
      interaction is then acceptable.<br>
      <br>
      <br>
      HTH.<br>
      <br>
      Best regards,<br>
      JON HAITZ<br>
      <br>
      <br>
      <br>
    </font><br>
    El 08/11/2010 13:43, Dawood Masslawi escribi&oacute;:
    <blockquote cite="mid:460223.72400.qm@web52303.mail.re2.yahoo.com"
      type="cite">
      <table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
        <tbody>
          <tr>
            <td style="font: inherit;" valign="top"><span
                class="Apple-style-span" style="font-family: 'Times New
                Roman'; font-size: medium;">
                <pre>Dear H. B.,</pre>
                <pre>
</pre>
                <pre>Basically there are four types of segmentation methods available in</pre>
                <pre>
</pre>
                <pre>ITK which are morphological, level-set, deformable and hybrid&nbsp;</pre>
                <pre>
</pre>
                <pre>segmentation methods. I completely agree with Jon, the ITK software&nbsp;</pre>
                <pre>
</pre>
                <pre>guide is a comprehensive source for learning about these different&nbsp;</pre>
                <pre>
</pre>
                <pre>methods but considering your application (image guided surgery with&nbsp;</pre>
                <pre>
</pre>
                <pre>FEM) any of the level-set methods seem suitable (e.g. Canny-Edge&nbsp;</pre>
                <pre>
</pre>
                <pre>Level Set Segmentation). These methods would give you a good control</pre>
                <pre>
</pre>
                <pre> over your resulting images since they are parametric
 approaches.&nbsp;</pre>
                <pre>
</pre>
                <pre>Another good resource for learning more about segmentation methods&nbsp;</pre>
                <pre>
</pre>
                <pre>is the book "image Processing, Analysis,&nbsp;and Computer Vision" by&nbsp;</pre>
                <pre>
</pre>
                <pre>Milan Sonka et al., chapter 7 of the book is about different&nbsp;</pre>
                <pre>
</pre>
                <pre>segmentation methods.</pre>
                <pre>
</pre>
                <pre>Regards,</pre>
                <pre>
</pre>
                <pre>Dawood Masslawi</pre>
                <pre>
</pre>
                <pre>&gt;Hi all,</pre>
                <pre>&gt;&nbsp;
&gt;Is there&nbsp;a good atomatic segmentation tool, that i give it set of images and the output is set of segmented images.
&gt;&nbsp;
&gt;Best Regards
&gt;&nbsp;&nbsp; H.B</pre>
              </span></td>
          </tr>
        </tbody>
      </table>
      <br>
      <pre wrap="">
<fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
_____________________________________
Powered by <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="http://www.kitware.com">www.kitware.com</a>

Visit other Kitware open-source projects at
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a>

Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.kitware.com/products/protraining.html">http://www.kitware.com/products/protraining.html</a>

Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a>

Follow this link to subscribe/unsubscribe:
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users</a>
</pre>
    </blockquote>
    <div class="moz-signature"><br>
    </div>
  </body>
</html>