<html>
<head>
<style><!--
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 10pt;
font-family:Tahoma
}
--></style>
</head>
<body class='hmmessage'>
<br>When I run DemonsRegistration using the options as given in the command line below, I can get a few output files like final image, deformation field etc. How would I get the rest of the output like "True field file"? <br>As the image was not deforming enough, I had opted to reduce sigma from the default value of 1.5 to 0.8.. is this the correct approach?<br>Size of the fixed and moving images are 384x384x64 pixels each. I would like to register using the multi-resolution approach starting with 1/4th number of pixels in all 3 axes (i.e, 96x96x16), going to 1/2 (ie., 192x192x32 pixels) and finally to the full image. How will I do this?<br><br>Command:<br>&gt;DemonsRegistration.exe -f CBCT1.mha -m CBCT4.mha -o Final.mha -O DefFld.mha -s 0.8 -d 1<br><br>Starting demons registration with the following arguments:<br>Arguments structure:<br>&nbsp; Fixed image file: CBCT1.mha<br>&nbsp; Moving image file: CBCT4.mha<br>&nbsp; Input field file:<br>&nbsp; Input transform file:<br>&nbsp; Output image file: Final.mha<br>&nbsp; Output field file: DefFld.mha<br>&nbsp; True field file:<br>&nbsp; Number of multiresolution levels: 3<br>&nbsp; Number of demons iterations: [ 15 10 5 ]<br>&nbsp; Deformation field sigma: 0.8<br>&nbsp; Update field sigma: 0<br>&nbsp; Maximum update step length: 2<br>&nbsp; Update rule: exponentialize and compose (Diffeomorphic)<br>&nbsp; Type of gradient: symmetrized (ESM for diffeomorphic and compositive)<br>&nbsp; Use histogram matching: false<br>&nbsp; Algorithm verbosity (debug level): 1<br><br>Thanks,<br>Ganesh<br><br><font style="" color="#1f497d" face="Verdana">************************************************************************</font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana"><br></font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana">
"What the mind of man can conceive and believe, It can achieve" - </font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana"><span class="ecxil">Napolean</span></font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana"> </font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana"><span class="ecxil">Hill</span></font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana"><br></font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana">
-Ganesh 
Narayanasamy,Ph.D., PostDoc-University of Kentucky Cancer Center</font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana"><br></font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana">
</font><font style="" color="#1f497d" face="Verdana">************************************************************************</font><br><br>                                               </body>
</html>