Yes, that is what happened. I lowered the mean. What I did not know is that in every iteration after computing the new mean and standard deviation, the output buffered is filled with zeros. So, every iteration starts with a completely blank image, not with the output of the previous iteration. This may make sense, however, it was misleading for me, I think it should be noted in the documentation.<br>

<br>Thanks,<br>Miklos<br><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, May 4, 2011 at 9:42 AM, Sergio Vera <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:sergio.vera@alma3d.com">sergio.vera@alma3d.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">

In a recent thread that I cannot find right now, someone said that Connf connected can discard already segmented pixels as iterations increase, giving certain conditions (ie: a big number of homogeneous pixels are segmented, lowering the mean and hence excluding pixels that were segmented before, if I remember correctly)<div>


<br><div class="gmail_quote"><div><div></div><div class="h5">On Tue, May 3, 2011 at 7:00 PM, Miklos Espak <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:espakm@gmail.com" target="_blank">espakm@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br></div>

</div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div></div><div class="h5">
The problem happens when the multiplier is below 1.0. Is it a misuse to specify such a multiplier?<br><br>I attached a sample code, and I will send the sample image in private. (0.5MB)<br><br>Thanks,<br>Miklos<br><br><div class="gmail_quote">




On Tue, May 3, 2011 at 3:05 PM, Karthik Krishnan <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:karthik.krishnan@kitware.com" target="_blank">karthik.krishnan@kitware.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">




It should not. Are you adding as seeds an entire mask of pixels ? Can<br>
you post a minimal working example demonstrating this<br>
<br>
thx<div><div></div><div><br>
<div><div></div><div><br>
On 5/3/11, Miklos Espak &lt;<a href="mailto:espakm@gmail.com" target="_blank">espakm@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>
&gt; Hi,<br>
&gt;<br>
&gt; can the ConfidenceConnectedImageFilter remove pixels from the detected<br>
&gt; region?<br>
&gt;<br>
&gt; I found that if I increase the number of iterations (from 3 to 30), the<br>
&gt; created mask will contain fewer pixels.<br>
&gt;<br>
&gt; The documentation says that &quot;letting the algorithm run for more iterations<br>
&gt; the region will end up engulfing the entire image&quot;, but I have not found<br>
&gt; anything about that the region may shrink.<br>
&gt;<br>
&gt; How is that possible?<br>
&gt;<br>
&gt; Regards,<br>
&gt; Miklos<br>
&gt;<br>
</div></div></div></div></blockquote></div><br>
<br></div></div>_____________________________________<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at<br>
<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
<a href="http://www.kitware.com/products/protraining.html" target="_blank">http://www.kitware.com/products/protraining.html</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
<a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users" target="_blank">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users</a><br>
<br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Sergio Vera<br><br> Alma IT Systems<br> C/ Vilana, 4B, 4º 1ª<br> 08022 Barcelona<br> T. <a href="tel:%28%2B34%29%20932%20380%20592" value="+34932380592" target="_blank">(+34) 932 380 592</a><br>

 <a href="http://www.alma3d.com" target="_blank">www.alma3d.com</a><br>
</div>
</blockquote></div><br>