<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40"><head><meta http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=us-ascii"><meta name=Generator content="Microsoft Word 12 (filtered medium)"><style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:PMingLiU;
        panose-1:2 2 5 0 0 0 0 0 0 0;}
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:PMingLiU;
        panose-1:2 2 5 0 0 0 0 0 0 0;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Calibri","sans-serif";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:purple;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;}
/* Page Definitions */
@page WordSection1
        {size:612.0pt 792.0pt;
        margin:72.0pt 90.0pt 72.0pt 90.0pt;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]--></head><body lang=ZH-TW link=blue vlink=purple style='text-justify-trim:punctuation'><div class=WordSection1><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>Hi all,<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>I tried to load two vector images, one using itk::Image&lt; itk::SymmetricSecondRankTensor&lt; double, 3&gt; &gt; and the other using itk::VectorImage&lt; double, 3 &gt;. I got the voxel values using itk::ImageRegionIterator::Get() function. However, very strange thing occurred to me. The order of the vector elements the iterators read behaves not in a way I create the phamton vector images. The vector I created is [0 1 2 3 4 5] for the symmetric tensor and [0 1 2 3 4 5 6 7 8] for the VectorImage. The voxel I got from the iterators are [0 1 3 2 4 5] and [0 1 3 6 2 4 7 5 8]. Why is that? Is there anything to do with the image headers? I&#8217;m using nifti .nii. <o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>The header file for the symmetric tensor image is as below. The header of VectorImage differs only in the dimension, which is dim: [5 20 20 20 1 9 1 1].<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; sizeof_hdr: 348<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; data_type: ''<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; db_name: ''<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; extents: 0<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp; session_error: 0<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; regular: 'r'<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; dim_info: 0<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; dim: [5 20 20 20 1 6 1 1]<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; intent_p1: 0<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; intent_p2: 0<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; intent_p3: 0<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; intent_code: 1005<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; datatype: 16<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; bitpix: 32<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; slice_start: 0<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; pixdim: [-1 0.8984 0.8984 3 1 1 1 1]<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; vox_offset: 352<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; scl_slope: 1<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; scl_inter: 0<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; slice_end: 0<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; slice_code: 0<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; xyzt_units: 2<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; cal_max: 0.0017<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; cal_min: 0<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp; slice_duration: 0<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; toffset: 0<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; glmax: 0.0017<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; glmin: 0<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; descrip: 'FSL4.0'<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; aux_file: ''<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; qform_code: 1<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; sform_code: 1<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; quatern_b: 0.0066<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; quatern_c: 0.9946<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; quatern_d: -0.0764<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; qoffset_x: 110.0322<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; qoffset_y: -113.4360<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; qoffset_z: 28.6710<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; srow_x: [-0.8895 0.0214 -0.4165 110.0322]<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; srow_y: [0.0021 0.8879 0.4586 -113.4360]<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; srow_z: [-0.1265 -0.1357 2.9353 28.6710]<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp; intent_name: ''<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; magic: 'n+1'<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>Best regards,<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>Meng-Kang Hsieh (Michael)<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>OpSciTech, Erasmus Mundus<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=EN-US>Delft University of Technology<o:p></o:p></span></p></div></body></html>