<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40"><head><meta http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=us-ascii"><meta name=Generator content="Microsoft Word 14 (filtered medium)"><style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        mso-fareast-language:EN-US;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:purple;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        mso-fareast-language:EN-US;}
@page WordSection1
        {size:612.0pt 792.0pt;
        margin:72.0pt 72.0pt 72.0pt 72.0pt;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]--></head><body lang=EN-CA link=blue vlink=purple><div class=WordSection1><p class=MsoNormal>Hi all,<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p><p class=MsoNormal>I am trying to define a particular schedule for a multi-resolution registration. <o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p><p class=MsoNormal>I have 2 data: the fixed image is a CT of 512x512x47<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;The moving image is a PET of 128x128x47<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p><p class=MsoNormal>I want to bring both data at same resolution at coarsest level of registration and I don&#8217; want to use data smaller that 32x32.&nbsp; So that, I will have 5 levels:<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Ct would be 32x32x47<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 64x64x47<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;128x128x47<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;256x256x47<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;512x512x47<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p><p class=MsoNormal>And Pet will be 32x32x47<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;64x64x47<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 128x128x47<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal style='margin-left:36.0pt;text-indent:36.0pt'>128x128x47<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal style='margin-left:36.0pt;text-indent:36.0pt'>128x128x47<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p><p class=MsoNormal>Here is an&nbsp; extract of my code:<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New";color:blue'>&nbsp; int</span><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'> <span style='color:#010001'>fixedImageNumberOfLevels</span> = <span style='color:#010001'>5</span>;<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp; <span style='color:blue'>int</span> <span style='color:#010001'>movingImageNumberOfLevels</span> = <span style='color:#010001'>3</span>;<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp; <span style='color:blue'>int</span> <span style='color:#010001'>numberOfLevels</span> = <span style='color:#010001'>qMax</span>(<span style='color:#010001'>fixedImageNumberOfLevels</span>, <span style='color:#010001'>movingImageNumberOfLevels</span>);<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp; <span style='color:#010001'>registration_</span>-&gt;<span style='color:#010001'>SetNumberOfLevels</span>(<span style='color:#010001'>numberOfLevels</span>);&nbsp;&nbsp;&nbsp; <o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp;&nbsp;<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp;&nbsp;<span style='color:#010001'>RegistrationType</span>::<span style='color:#010001'>ScheduleType</span>&nbsp; <span style='color:#010001'>fixedImageSchedule</span> = <span style='color:#010001'>registration_</span>-&gt;<span style='color:#010001'>GetFixedImagePyramid</span>()-&gt;<span style='color:#010001'>GetSchedule</span>();<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp; <span style='color:blue'>unsigned</span> <span style='color:blue'>int</span> <span style='color:#010001'>shrinkFactor</span> = 1 &lt;&lt; (<span style='color:#010001'>fixedImageNumberOfLevels</span> - 1);<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp; <span style='color:#010001'>fixedImageSchedule</span>[0][0] = <span style='color:#010001'>shrinkFactor</span>;<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp; <span style='color:#010001'>fixedImageSchedule</span>[0][1] = <span style='color:#010001'>shrinkFactor</span>;<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp; <span style='color:#010001'>fixedImageSchedule</span>[0][2] = 1;<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp; <span style='color:blue'>for</span> (<span style='color:blue'>int</span> <span style='color:#010001'>level</span> = 1; <span style='color:#010001'>level</span> &lt; <span style='color:#010001'>numberOfLevels</span>; <span style='color:#010001'>level</span>++){<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp;&nbsp;&nbsp; <span style='color:#010001'>fixedImageSchedule</span>[<span style='color:#010001'>level</span>][0] = 2 * <span style='color:#010001'>fixedImageSchedule</span>[<span style='color:#010001'>level</span>-1][0];<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp;&nbsp;&nbsp; <span style='color:#010001'>fixedImageSchedule</span>[<span style='color:#010001'>level</span>][1] = 2 * <span style='color:#010001'>fixedImageSchedule</span>[<span style='color:#010001'>level</span>-1][1];<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp;&nbsp;&nbsp; <span style='color:#010001'>fixedImageSchedule</span>[<span style='color:#010001'>level</span>][2] = 1;<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp; }<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp; <span style='color:#010001'>registration_</span>-&gt;<span style='color:#010001'>GetFixedImagePyramid</span>()-&gt;<span style='color:#010001'>SetSchedule</span>(<span style='color:#010001'>fixedImageSchedule</span>);<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp; <span style='color:#010001'>RegistrationType</span>::<span style='color:#010001'>ScheduleType</span>&nbsp; <span style='color:#010001'>movingImageSchedule</span>= <span style='color:#010001'>registration_</span>-&gt;<span style='color:#010001'>GetMovingImagePyramid</span>()-&gt;<span style='color:#010001'>GetSchedule</span>();<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp; <span style='color:#010001'>shrinkFactor</span> = 1 &lt;&lt; (<span style='color:#010001'>movingImageNumberOfLevels</span> - 1);<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp; <span style='color:#010001'>movingImageSchedule</span>[0][0] = <span style='color:#010001'>shrinkFactor</span>;<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp; <span style='color:#010001'>movingImageSchedule</span>[0][1] = <span style='color:#010001'>shrinkFactor</span>;<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp; <span style='color:#010001'>movingImageSchedule</span>[0][2] = 1;<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp; <span style='color:blue'>for</span> (<span style='color:blue'>int</span> <span style='color:#010001'>level</span> = 1; <span style='color:#010001'>level</span> &lt; <span style='color:#010001'>numberOfLevels</span>; <span style='color:#010001'>level</span>++){<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp;&nbsp;&nbsp; <span style='color:#010001'>movingImageSchedule</span>[<span style='color:#010001'>level</span>][0] = 2 * <span style='color:#010001'>movingImageSchedule</span>[<span style='color:#010001'>level</span>-1][0];<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp;&nbsp;&nbsp; <span style='color:#010001'>movingImageSchedule</span>[<span style='color:#010001'>level</span>][1] = 2 * <span style='color:#010001'>movingImageSchedule</span>[<span style='color:#010001'>level</span>-1][1];<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp;&nbsp;&nbsp; <span style='color:#010001'>movingImageSchedule</span>[<span style='color:#010001'>level</span>][2] = 1;<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp; }<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal style='text-autospace:none'><span style='font-size:12.0pt;font-family:"Courier New"'>&nbsp; <span style='color:#010001'>registration_</span>-&gt;<span style='color:#010001'>GetFixedImagePyramid</span>()-&gt;<span style='color:#010001'>SetSchedule</span>(<span style='color:#010001'>movingImageSchedule</span>);<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p><p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p><p class=MsoNormal>As printing the info during registration, I find out that: <o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Numer of levels = 1<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>FixedImagePyramidSchedule is empty, same for MovingImagePyramid<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>And fixed image region is of size<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Level 0: 64x64x47<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Level 1:128x128x47<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p><p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p><p class=MsoNormal>I tried also, SetStartingShrinkSchedule, which I found very convenient but it didn&#8217;t work. I also tried SetSchedules(fixedImageSchedule, &nbsp;movingImageSchedule), no chance either. What am I doing true?<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p><p class=MsoNormal>Please, help.<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Regards,<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Isabelle<o:p></o:p></p></div></body></html>