if your segmentation is partial volume, then threshould it at 0.5, if your segmentation is an signed distance map, threshould it at 0, the map should be 1 inside and o outside<div>then multiply your mask with the original image</div>
<br><div class="gmail_quote">On Wed, Apr 18, 2012 at 4:06 PM, Xiaopeng Yang <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:yxp233@postech.ac.kr">yxp233@postech.ac.kr</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div lang="EN-US" link="blue" vlink="purple"><div><p class="MsoNormal">Dear Users,<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><p class="MsoNormal">I have two images, an original abdominal gray-scale CT image, and a segmented mask image of the liver from the CT image. I would like to create a new gray-scale image from the original CT image so that in the new image, the intensity value of the points outside the segmented liver is set to be 0, while the points within the segmented liver do not change. <u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><p class="MsoNormal">I think there should be some example to do this. But I could not find any one from Google search. If you know any example, please share it with me.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p><p class="MsoNormal">Thank you,<u></u><u></u></p><p class="MsoNormal">Xiaopeng<u></u><u></u></p></div></div><br>_____________________________________<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at<br>
<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
<a href="http://www.kitware.com/products/protraining.php" target="_blank">http://www.kitware.com/products/protraining.php</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
<a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users" target="_blank">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users</a><br>
<br></blockquote></div><br>