Thanks Nick. I will have a look at the code. Do I have to download the entire package<br>to use Atropos? <br>Additionally, to the group, are there any filters for doing a mixture model based<br>segmentations within the standard ITK ? <br>
Thanks,<br>Sid<br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Apr 18, 2012 at 9:06 AM, Nicholas Tustison <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:ntustison@gmail.com">ntustison@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Hi Sid,<br>
<br>
We built an ITK-based E-M segmentation algorithm called Atropos<br>
which is available through ANTS<br>
<br>
<a href="http://sourceforge.net/projects/advants/" target="_blank">http://sourceforge.net/projects/advants/</a><br>
<br>
and is detailed in the following publication<br>
<br>
<a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21373993" target="_blank">http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21373993</a><br>
<br>
Nick<br>
<div><div class="h5"><br>
On Apr 18, 2012, at 11:49 AM, Siddharth Srivastava wrote:<br>
<br>
&gt; Hi everyone,<br>
&gt;       I wanted to know what options are available to me for writing an Expectation-Maximization<br>
&gt; segmentation routine using ITK filters? Also, are there ways to introduce MRF based regularization<br>
&gt; in the framework using ITK based filters? The data shall be 2D or 3D.<br>
&gt;      An advice on already implemented filters, or Insignt publications would be really helpful.<br>
&gt; Thanks,<br>
&gt; Sid.<br>
</div></div>&gt; _____________________________________<br>
&gt; Powered by <a href="http://www.kitware.com" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
&gt;<br>
&gt; Visit other Kitware open-source projects at<br>
&gt; <a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
&gt;<br>
&gt; Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
&gt; <a href="http://www.kitware.com/products/protraining.php" target="_blank">http://www.kitware.com/products/protraining.php</a><br>
&gt;<br>
&gt; Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
&gt; <a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br>
&gt;<br>
&gt; Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
&gt; <a href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users" target="_blank">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users</a><br>
<br>
</blockquote></div><br>