<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
</head>
<body style="word-wrap:break-word; color:rgb(0,0,0); font-size:14px; font-family:Calibri,sans-serif">
<div>
<div>
<div><br>
</div>
<div>
<div>If you download the latest version of BRAINS:</div>
<div><br>
</div>
<div>git clone&nbsp;<a href="mailto:git@github.com">git@github.com</a>:BRAINSia/BRAINSStandAlone.git</div>
<div>
<div>
<div>mkdir BSA-build</div>
<div>cd BSA-build</div>
<div>ccmake ../BRAINSStandAlone</div>
<div>make</div>
<div><br>
</div>
<div>...</div>
<div>Then there a is a program called BRAINSTransformConvert that you can use:</div>
<div><br>
</div>
<div>BRAINSTransformConvert --inputTransform myVersorParameters.mat &nbsp;--outputTransformType&nbsp;DisplacementField&nbsp;--displacementVolume MyVectorField.nrrd&nbsp; &nbsp;--referenceVolume myReferenceVolume.nii.gz</div>
</div>
</div>
</div>
<div>
<div><br>
</div>
<div>...</div>
<div>This tool will be incorporated with the Slicer package later this summer.</div>
<div><br>
</div>
<div>Hans</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
</div>
<div><br>
</div>
<div>
<div>
<div>--&nbsp;</div>
<div>
<div>
<div style="font-family:Calibri; font-size:15px"><font face="Arial" size="2"><span style="font-size:10pt">Hans J. Johnson, Ph.D.</span></font></div>
<div style="font-family:Calibri; font-size:15px"><font face="Arial" size="2"><span style="font-size:10pt"><a href="mailto:hans-johnson@uiowa.edu">hans-johnson@uiowa.edu</a></span></font></div>
<div style="font-family:Calibri; font-size:15px"><font face="Arial" size="2"><span style="font-size:10pt">Assistant Professor of Psychiatry</span></font></div>
<div style="font-family:Calibri; font-size:15px"><span class="Apple-style-span" style="font-size:13px; font-family:Arial">University of Iowa Carver College of Medicine</span></div>
<div style="font-family:Calibri; font-size:15px"><font face="Arial" size="2"><span style="font-size:10pt"><span class="Apple-style-span" style="font-family:Calibri; font-size:15px">
<div><span class="Apple-style-span" style="font-size:13px; font-family:Arial">W278 GH, 200 Hawkins Drive</span></div>
</span></span></font></div>
<div style="font-family:Calibri; font-size:15px"><font face="Arial" size="2"><span style="font-size:10pt">Iowa City, Iowa 52242</span></font></div>
<div style="font-family:Calibri; font-size:15px"><font face="Arial" size="2"><span style="font-size:10pt">Phone:&nbsp; 319-353-8587</span></font></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div><br>
</div>
<span id="OLK_SRC_BODY_SECTION">
<div style="font-family:Calibri; font-size:11pt; text-align:left; color:black; border-bottom:medium none; border-left:medium none; padding-bottom:0in; padding-left:0in; padding-right:0in; border-top:#b5c4df 1pt solid; border-right:medium none; padding-top:3pt">
<span style="font-weight:bold">From: </span>Abayiz &lt;<a href="mailto:abayiz@yahoo.com">abayiz@yahoo.com</a>&gt;<br>
<span style="font-weight:bold">Reply-To: </span>Abayiz &lt;<a href="mailto:abayiz@yahoo.com">abayiz@yahoo.com</a>&gt;<br>
<span style="font-weight:bold">Date: </span>Wednesday, May 2, 2012 3:09 AM<br>
<span style="font-weight:bold">To: </span>itk &lt;<a href="mailto:insight-users@itk.org">insight-users@itk.org</a>&gt;<br>
<span style="font-weight:bold">Subject: </span>[Insight-users] Build vector field from rigid transformation parameters<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>
<div>
<div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times new roman,new york,times,serif; font-size:12pt">
<div>Hello,</div>
<div><br>
</div>
<div>I want to build a corresponding vector field from transformation parameters of a rigid registration. Since they are of different type, I have difficulties. Is there any filter for doing this?
<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>Thank you. <br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>Abayiz</div>
</div>
</div>
</div>
</span><br>
<br>
<hr>
Notice: This UI Health Care e-mail (including attachments) is covered by the Electronic Communications Privacy Act, 18 U.S.C. 2510-2521, is confidential and may be legally privileged.&nbsp; If you are not the intended recipient, you are hereby notified that any
 retention, dissemination, distribution, or copying of this communication is strictly prohibited.&nbsp; Please reply to the sender that you have received the message in error, then delete it.&nbsp; Thank you.
<hr>
</body>
</html>