Pietro,<div><br></div><div>Is your segmentation really disconnected or is an issue with visualization?</div><div>I mean, marching cubes isovolumes often do not work extremelly well with thin structures, and they generate apparently unconnected structures while in the binary 27-connected neighborhood everithing is connected. This is specially true on thin or small regions.</div>
<div><br></div><div>If objects are really unconnected some options are hole filling methods (morphologycal closing) or iterativeVotingHoleFill filters</div><div><br></div><div>Regards</div><div><br></div><div><div class="gmail_quote">
On Wed, May 23, 2012 at 11:41 AM, Pietro Nardelli <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:pie.nardelli@gmail.com" target="_blank">pie.nardelli@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Hi everybody,<br>
<br>
I have a question: does anyone know how could fix disconnected label?<br>
I explain: I&#39;m developing a module to segment the airway of the lung<br>
starting from a DICOM dataset, and in order to do so I&#39;m using a<br>
threshold connected method. Now, since this method use a<br>
26-neighborhood region growing, I get some disconnected pieces of<br>
branches (I&#39;ve attached a picture of what I mean). Does something<br>
exist to create a piece of label in order to fix these gaps?<br>
<br>
<br>
Thanks so much,<br>
<br>
Pietro<br>
<br>_____________________________________<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at<br>
<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
<a href="http://www.kitware.com/products/protraining.php" target="_blank">http://www.kitware.com/products/protraining.php</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
<a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users" target="_blank">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users</a><br>
<br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>Sergio Vera<br><br> Alma IT Systems<br> C/ Vilana, 4B, 4º 1ª<br> 08022 Barcelona<br> T. (+34) 932 380 592<br> <a href="http://www.alma3d.com">www.alma3d.com</a><br>

</div>