Hi Cagatay,<div><br></div><div><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:13px;background-color:rgb(255,255,255)">I am very sorry for the long delay in reply. Although I am subscribed to the ITK users list, I do not read it carefully due to the heavy traffic, and so missed your message until now.</div>

<div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:13px;background-color:rgb(255,255,255)"><br></div><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:13px;background-color:rgb(255,255,255)">

<div style="color:rgb(0,0,0);font-family:arial;font-size:small">&gt; Are there any up-to-date pointers on how to compile </div><div style="color:rgb(0,0,0);font-family:arial;font-size:small">&gt; and configure bioformats for ITK ? </div>

<div><br></div><div>The most up-to-date instructions for BF-ITK are available here:</div><div>   <a href="http://loci.wisc.edu/bio-formats/itk">http://loci.wisc.edu/bio-formats/itk</a></div><div><br></div><div>Please let us know of any problems. Please use the ome-users mailing list (<a href="http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users/">http://lists.openmicroscopy.org.uk/mailman/listinfo/ome-users/</a>), which is the best place for Bio-Formats support questions.</div>

</div><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:13px;background-color:rgb(255,255,255)"><br></div><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:13px;background-color:rgb(255,255,255)">

Regards,</div><div style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:13px;background-color:rgb(255,255,255)">Curtis</div><br><div class="gmail_quote">On Mon, Jul 30, 2012 at 2:29 PM, Cagatay Bilgin <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:bilgincc@gmail.com" target="_blank">bilgincc@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hello everyone, <div><br><div>I am trying to build bioformats but couldn&#39;t succeed yet.<div><div><br></div><div>The first document I tried was the following one</div>

<div><a href="http://www.vtk.org/Wiki/ITK_Release_4/Microscopy/File_Formats/Bio-Formats" target="_blank">http://www.vtk.org/Wiki/ITK_Release_4/Microscopy/File_Formats/Bio-Formats</a></div>
<div>The document mentions bf-cpp directory which</div><div>does not exist in the bioformats directory anymore. </div><div>I see a bf-itk-pipe directory though. </div></div><div><br></div><div>The second document I tried is </div>


<div><a href="http://loci.wisc.edu/bio-formats/itk" target="_blank">http://loci.wisc.edu/bio-formats/itk</a></div><div>which I was able to compile and configure </div><div>as suggested but failed to read/write ics/stk files</div>

<div>at the end of the day. </div>
<div><br></div><div>Are there any up-to-date pointers on how to compile </div><div>and configure bioformats for ITK ? </div><div><br></div><div>Thank you,</div><div>Cagatay </div></div></div>
<br>_____________________________________<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at<br>
<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
<a href="http://www.kitware.com/products/protraining.php" target="_blank">http://www.kitware.com/products/protraining.php</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
<a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users" target="_blank">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>