<html dir="ltr"><head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Windows-1252">
<style>@font-face {
        font-family: Calibri;
}
@page WordSection1 {margin: 1.0in 1.0in 1.0in 1.0in; }
P.MsoNormal {
        FONT-SIZE: 11pt; MARGIN: 0in 0in 0pt; FONT-FAMILY: "Calibri","sans-serif"
}
LI.MsoNormal {
        FONT-SIZE: 11pt; MARGIN: 0in 0in 0pt; FONT-FAMILY: "Calibri","sans-serif"
}
DIV.MsoNormal {
        FONT-SIZE: 11pt; MARGIN: 0in 0in 0pt; FONT-FAMILY: "Calibri","sans-serif"
}
A:link {
        COLOR: blue; TEXT-DECORATION: underline
}
SPAN.MsoHyperlink {
        COLOR: blue; TEXT-DECORATION: underline
}
A:visited {
        COLOR: purple; TEXT-DECORATION: underline
}
SPAN.MsoHyperlinkFollowed {
        COLOR: purple; TEXT-DECORATION: underline
}
SPAN.EmailStyle17 {
        COLOR: windowtext; FONT-FAMILY: "Calibri","sans-serif"
}
.MsoChpDefault {
        FONT-FAMILY: "Calibri","sans-serif"
}
DIV.WordSection1 {
        
}
</style>
<meta content="MSHTML 6.00.6001.18639" name="GENERATOR">
<style id="owaTempEditStyle"></style><style title="owaParaStyle"><!--P {
        MARGIN-TOP: 0px; MARGIN-BOTTOM: 0px
}
--></style>
</head>
<body lang="EN-US" dir="ltr" vlink="purple" link="blue" ocsi="x">
<div style="FONT-SIZE: x-small; COLOR: #000000; DIRECTION: ltr; FONT-FAMILY: Tahoma">
<div>&nbsp;</div>
<div dir="ltr"><font color="#000000" size="2"><span style="COLOR: #1f497d"><font face="Arial">Hi Alex,</font></span></div>
<div dir="ltr">
<div dir="ltr">
<p class="MsoNormal"><span style="COLOR: #1f497d"><font face="Arial"></font></span>&nbsp;</p>
<p class="MsoNormal"><span style="COLOR: #1f497d"><font face="Arial">Thanks for your reply.</font></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="COLOR: #1f497d"><font face="Arial">I have two sets of dicom images.one is CT set(40 .dcm files) and the other is MRI set(40 .dcm files).</font></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="COLOR: #1f497d"><font face="Arial">I have gone through the example “ImageRegistration8.cxx”.</font></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="COLOR: #1f497d"><font face="Arial">Here the input to the example are two .mha files and output is a .mhd file.</font></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="COLOR: #1f497d"><font face="Arial">What my doubt is that how will I convert the two sets(CT and MRI)&nbsp;of dicom images to two separate .mha files to be given as input to the &quot;ImageRegistration8.cxx&quot;.</font></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="COLOR: #1f497d"><font face="Arial" size="3">example.</font></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="COLOR: #1f497d"><font face="Arial" size="3"></font></span>&nbsp;</p>
<p class="MsoNormal"><span style="COLOR: #1f497d"><font face="Arial" size="3"></font></span>&nbsp;</p>
<p class="MsoNormal"><span style="COLOR: #1f497d"><font face="Arial">Please guide me on this.</font></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="COLOR: #1f497d"><font face="Arial"></font></span>&nbsp;</p>
<p class="MsoNormal"><span style="COLOR: #1f497d"><font face="Arial">Thanking you in advance,</font></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="COLOR: #1f497d"><font face="Arial"></font></span>&nbsp;</p>
<p class="MsoNormal"><span style="COLOR: #1f497d"><font face="Arial">Regards,</font></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="COLOR: #1f497d"><font face="Arial">Ashwath.</font></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="COLOR: #1f497d"><font face="Arial"></font></span>&nbsp;</p>
</font></div>
</div>
<div id="divRpF890855" style="DIRECTION: ltr"><font face="Arial">
<hr tabindex="-1">
</font><font face="Tahoma" color="#000000" size="2"><b>From:</b> insight-users-bounces@itk.org [insight-users-bounces@itk.org] On Behalf Of alex Dowson [alexdowson@hotmail.com]<br>
<b>Sent:</b> Tuesday, November 06, 2012 11:01 AM<br>
<b>To:</b> Kiran Gachchi; insight-users@itk.org<br>
<b>Subject:</b> Re: [Insight-users] 3D Fusion.<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>
<div dir="ltr">
<div style="FONT-SIZE: 12pt; COLOR: #000000; FONT-FAMILY: 'Calibri'">
<div>Kiran</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>You can do it following ways </div>
<div>&nbsp;</div>
<div>1) do the registration of both images and produce single 3D image . See the registration section in ITK documentation or google it</div>
<div>2) Generate surface from that 3D image using Marching Cubes .</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Another method</div>
<div>1) Generate two surface from two different 3D image using marching cubes.</div>
<div>2) Register 3D surface with Iterative closet point algorithm described in itk for surface.</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Naresh</div>
<div>&nbsp;</div>
<div style="DISPLAY: inline; FONT-WEIGHT: normal; FONT-SIZE: small; COLOR: #000000; FONT-STYLE: normal; FONT-FAMILY: 'Calibri'; TEXT-DECORATION: none">
<div style="FONT: 10pt tahoma">
<div><font face="Calibri" size="3"></font>&nbsp;</div>
<div style="BACKGROUND: #f5f5f5">
<div><b>From:</b> <a title="Kiran.Gachchi@hcl.com" href="mailto:Kiran.Gachchi@hcl.com">
Kiran Gachchi</a> </div>
<div><b>Sent:</b> Tuesday, November 06, 2012 10:41 AM</div>
<div><b>To:</b> <a title="insight-users@itk.org" href="mailto:insight-users@itk.org">
insight-users@itk.org</a> </div>
<div><b>Subject:</b> [Insight-users] 3D Fusion.</div>
</div>
</div>
<div>&nbsp;</div>
</div>
<div style="DISPLAY: inline; FONT-WEIGHT: normal; FONT-SIZE: small; COLOR: #000000; FONT-STYLE: normal; FONT-FAMILY: 'Calibri'; TEXT-DECORATION: none">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">Hi All,</p>
<p class="MsoNormal">&nbsp;</p>
<p class="MsoNormal">I have a set of 2D DICOM CT scan files and also have the other set of 2D DICOM MRI scan files.</p>
<p class="MsoNormal">I want to generate a 3D Volume of CT images and a 3D Volume of MRI images.</p>
<p class="MsoNormal">After generating the two 3D volumes, I want to fuse both of the 3D Volumes and generate a output fused 3D volume.</p>
<p class="MsoNormal">&nbsp;</p>
<p class="MsoNormal">How to go about the above task.</p>
<p class="MsoNormal">Please help me in this.</p>
<p class="MsoNormal">&nbsp;</p>
<p class="MsoNormal">Thanking you in advance,</p>
<p class="MsoNormal">&nbsp;</p>
<p class="MsoNormal">Regards,</p>
<p class="MsoNormal"><span style="COLOR: black">Kiran.</span></p>
<p class="MsoNormal">&nbsp;</p>
<p class="MsoNormal">&nbsp;</p>
<p class="MsoNormal">&nbsp;</p>
</div>
<span style="FONT-SIZE: 7.5pt; COLOR: gray; FONT-FAMILY: 'Arial','sans-serif'">
<p class="MsoNormal" style="MARGIN: 0in 0in 0pt"><br>
<br>
<font style="FONT-SIZE: 9px; COLOR: gray; FONT-FAMILY: 'Arial','sans-serif'">::DISCLAIMER::<br>
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------</font></p>
<p class="MsoNormal" style="MARGIN: 0in 0in 0pt"><font style="FONT-SIZE: 11px; COLOR: gray; FONT-FAMILY: 'Arial','sans-serif'">The contents of this e-mail and any attachment(s) are confidential and intended for the named recipient(s) only.<br>
E-mail transmission is not guaranteed to be secure or error-free as information could be intercepted, corrupted,
<br>
lost, destroyed, arrive late or incomplete, or may contain viruses in transmission. The e mail and its contents
<br>
(with or without referred errors) shall therefore not attach any liability on the originator or HCL or its affiliates.
<br>
Views or opinions, if any, presented in this email are solely those of the author and may not necessarily reflect the
<br>
views or opinions of HCL or its affiliates. Any form of reproduction, dissemination, copying, disclosure, modification,
<br>
distribution and / or publication of this message without the prior written consent of authorized representative of
<br>
HCL is strictly prohibited. If you have received this email in error please delete it and notify the sender immediately.
<br>
Before opening any email and/or attachments, please check them for viruses and other defects.</font></p>
<p class="MsoNormal" style="MARGIN: 0in 0in 0pt"><font style="FONT-SIZE: 11px; COLOR: gray; FONT-FAMILY: 'Arial','sans-serif'">----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------</font></span></p>
<p></p>
<hr>
_____________________________________<br>
Powered by www.kitware.com<br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at<br>
http://www.kitware.com/opensource/opensource.html<br>
<br>
Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
http://www.kitware.com/products/protraining.php<br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ<br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>