<div dir="ltr">RealValueType would mean an image with a datatype of &#39;double&#39; and not &#39;float&#39; as you have instantiated.<div><br></div><div>HTH</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">
On Thu, Apr 18, 2013 at 6:05 PM, Emma Saunders <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:emmasaunders123@gmail.com" target="_blank">emmasaunders123@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr">Hi Nick / all,<div><br></div><div>Thanks for your recent input w.r.t using a Confidence Image with the  itk::DisplacementFieldToBSplineImageFilter.  I am attempting to use it by creating my own confidence image via:</div>

<div><br></div><div><div>           typedef float PixelType;</div><div><span style="white-space:pre-wrap">        </span>  typedef itk::Image&lt; PixelType, 3 &gt;          ImageType;</div><div><span style="white-space:pre-wrap">        </span>  ImageType::Pointer ConfidenceImage = ImageType::New();</div>

</div><div><br></div><div><br></div><div>And applying appropriate size, index values etc.</div><div><br></div><div>and applying via Bspline-&gt;SetConfidenceImage(ConfidenceImage) </div><div>
<br></div><div>However an error I receive is &quot;no matching function to: :SetConfidenceImage(itk::SmartPointer&lt;itk::Image&lt;float, 3u&gt; &gt;&amp;)’&quot;</div><div><br></div><div><br></div><div>
Output mentions using ::SetConfidenceImage(const itk::Image&lt;typename TOutputImage::PixelType::RealValueType, itk::DisplacementFieldToBSplineImageFilter&lt;TInputImage, TOutputImage&gt;::ImageDimension&gt;*)</div><div>

<br></div><div>Does this require I use a const image, if so I&#39;m having trouble with defining such could someone point me in the right direction of how to create a const image as I can only find documentation w.r.t smartpointer images, or is there something that I have done wrong w.r.t the filter??</div>

<div><br></div><div>Advice appreciated</div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><div><br></div><div>Emma</div><div><br></div><div><br></div><div><br></div></font></span></div><div class="HOEnZb"><div class="h5"><div class="gmail_extra">
<br><br><div class="gmail_quote">
On Wed, Apr 17, 2013 at 4:37 PM, Nick Tustison <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:ntustison@gmail.com" target="_blank">ntustison@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

<div style="word-wrap:break-word">Hi Emma,<div><br></div><div>Please keep the conversation on the email list as others</div><div>might have similar questions.  </div><div><br></div><div>You&#39;re getting expected behavior based on what you&#39;re</div>

<div>telling me.  I assume your sparse displacement field is </div><div>actually a &quot;dense&quot; displacement field with sparse non-zero </div><div>entries (at least that&#39;s the way the filter sees it).  Fortunately,</div>

<div>there&#39;s an easy work-around.  I put an option in the filter to</div><div>specify a confidence image which can be used to spatially </div><div>vary the weighting of individual displacement vectors.  </div><div><br>

</div><div>filter-&gt;SetConfidenceImage( confidenceImage );</div><div><br></div><div>So, in your case, you would define the confidence image as an</div><div>image with a non-zero constant value (let&#39;s say &#39;1&#39; since only </div>

<div>the relative weighting matters) at the voxels that have non-zero </div><div>displacements.  THat should give you what you need.</div><div><br></div><div>Nick</div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br>

</div><div>The filter is treating your zer</div><div><div><div><br></div><div><div><div>On Apr 17, 2013, at 11:16 AM, Emma Saunders &lt;<a href="mailto:emmasaunders123@gmail.com" target="_blank">emmasaunders123@gmail.com</a>&gt; wrote:</div>

<br><blockquote type="cite"><div dir="ltr">Hi Nick,<div><br></div><div>Thanks for pointing me in the correct direction of the test.</div><div><br></div><div>I am new to ITK, would you kindly offer some advice w.r.t itkDisplacementFieldToBSplineImageFilter.h</div>


<div><br></div><div>I have as input to this filter a sparse vector field, 5, 2D slices, each slice is spaced 20 voxels apart, I would like a dense approximation of this field and was under the impression this filter could do that, i.e interpolate between the slices</div>


<div><br></div><div>When I run the filter however and use bspliner-&gt;GetDisplacementField() what returns is something similar to the original, i.e the gaps inbetween are not filled in or interpolated.  I have left the spline order at 3, fitting levels at 5 and control points at 4,</div>


<div><br></div><div>Would you be-able to clarify that my expectation of this filter are correct or offer any other alternatives for vector field interpolation?</div><div><br></div><div>Kind regards</div>
<div><br></div><div>Emma</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Apr 16, 2013 at 8:31 PM, Nick Tustison <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:ntustison@gmail.com" target="_blank">ntustison@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>


<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Did you look at the test?<br>
<br>
ITK/Modules/Filtering/DisplacementField/test/itkDisplacementFieldToBSplineImageFilterTest.cxx<br>
<div><div><br>
<br>
<br>
On Apr 16, 2013, at 2:47 PM, Emma Saunders &lt;<a href="mailto:emmasaunders123@gmail.com" target="_blank">emmasaunders123@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>
<br>
&gt; Hi all,<br>
&gt;<br>
&gt; could anyone point me towards a working example which utilizes:<br>
&gt;<br>
&gt; DisplacementFieldToBSplineImageFilter<br>
&gt;<br>
&gt; Kind regards<br>
&gt;<br>
&gt; Emma<br>
</div></div>&gt; _____________________________________<br>
&gt; Powered by <a href="http://www.kitware.com/" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
&gt;<br>
&gt; Visit other Kitware open-source projects at<br>
&gt; <a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
&gt;<br>
&gt; Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
&gt; <a href="http://www.kitware.com/products/protraining.php" target="_blank">http://www.kitware.com/products/protraining.php</a><br>
&gt;<br>
&gt; Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
&gt; <a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br>
&gt;<br>
&gt; Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
&gt; <a href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users" target="_blank">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users</a><br>
<br>
</blockquote></div><br></div>
</blockquote></div><br></div></div></div></div></blockquote></div><br></div>
</div></div><br>_____________________________________<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at<br>
<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
<a href="http://www.kitware.com/products/protraining.php" target="_blank">http://www.kitware.com/products/protraining.php</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
<a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users" target="_blank">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users</a><br>
<br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>karthik
</div>