<div dir="ltr">Since you&#39;re on Linux, you can set the <span style="color:rgb(0,0,0)">ITK_GLOBAL_DEFAULT_NUMBER_OF_THREADS environment variable instead (no need to recompile). Just type the following at the command line</span><div>
<span style="color:rgb(0,0,0)">export </span><span style="color:rgb(0,0,0)">ITK_GLOBAL_DEFAULT_NUMBER_OF_THREADS=1</span></div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Mon, Nov 18, 2013 at 8:14 AM, Mike Chinander <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:chinander@gmail.com" target="_blank">chinander@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Do you still see a difference if you add: <span style>itk::MultiThreader::SetGlobalMaximumNumberOfThreads( 1 );</span><div>
<span style>to the beginning of the 4.4 version?</span><br>
</div></div><div class="HOEnZb"><div class="h5"><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Mon, Nov 18, 2013 at 8:08 AM, Jagjeet Nain <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:jagjeet.nain@gmail.com" target="_blank">jagjeet.nain@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div><div><div>Hi,<br></div>Here is similar plot but in this case Y axis represents mis-registration between two images in Y direction.<br>

</div>Any idea or thoughts why the misregistration results are different in two ITKs?<br>

</div>BR<span><font color="#888888"><br></font></span></div><span><font color="#888888">Jagjeet<br></font></span></div><div><div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">
On Tue, Nov 12, 2013 at 5:05 PM, Jagjeet Nain <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:jagjeet.nain@gmail.com" target="_blank">jagjeet.nain@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi Brad,<div>Sorry, I should have explained this already.</div><div>Y Axis is Misregistration between a pair of image in &quot;X-direction&quot;. One point represents Mean of Misregistration in X-direction computed from ~150 locations.</div>



<div>X axis is time-series of image pairs.</div><div>I could also send similar plot in Y direction, if you want.</div><div>BR</div><span><font color="#888888"><div>Jagjeet</div></font></span></div><div>
<div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Nov 12, 2013 at 2:51 PM, Bradley Lowekamp <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:brad@lowekamp.net" target="_blank">brad@lowekamp.net</a>&gt;</span> wrote:<br>



<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div style="word-wrap:break-word">Hello,<div><br></div><div>What is the y-axis?</div><div><br></div><div>Brad</div><div>



<br><div><div><div><div>On Nov 12, 2013, at 8:45 AM, Jagjeet Nain &lt;<a href="mailto:jagjeet.nain@gmail.com" target="_blank">jagjeet.nain@gmail.com</a>&gt; wrote:</div><br></div></div><blockquote type="cite"><div>
<div><div dir="ltr"><br><br><div class="gmail_quote"><br><div dir="ltr"><div><div><div><div><div>Hi,<br></div>I was trying to run an Image Registration program which uses ITK&#39;s Mattes Mutual Information method to compute misregistration between an image pair and is based on ../Examples/Registration/ImageRegistration4.cxx program.<br>





Then I linked this program with two different ITKs (3.2 &amp; 4.4) and tried running two executable on ~200 image pairs to find misregistration between each pair.<br><br>I was expecting same output from two ITKs(running system is same, Linux 32 in both case) but I am bit puzzled to see that there are misregistration differences between two ITK versions, Also these differences are not negligible they are of the order of 0.1m in a pixel of size 3m. Attached are misregistration results from two ITKs.<br>





<br>I guess somebody might have done similar comparison between different ITK versions, what is their opinion? Are these differences expected?<br></div>If differences between two ITKs are expected, then which one is better 3.2 or 4.4?<br>





</div>Thanks.<br></div><div>Any help or pointer in this respect is well appreciated.<br></div>BR<span><font color="#888888"><br></font></span></div><span><font color="#888888">Jagjeet<br></font></span></div>

</div><br></div>
</div></div><span>&lt;MisregistrationDifference3.2Vs4.4.jpg&gt;</span>_____________________________________<br>Powered by <a href="http://www.kitware.com" target="_blank">www.kitware.com</a><br><br>Visit other Kitware open-source projects at<br>



<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br><br>Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br><a href="http://www.kitware.com/products/protraining.php" target="_blank">http://www.kitware.com/products/protraining.php</a><br>



<br>Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br><a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br><br>Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br><a href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users" target="_blank">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users</a><br>



</blockquote></div><br></div></div></blockquote></div><br></div>
</div></div></blockquote></div><br></div>
</div></div><br>_____________________________________<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at<br>
<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
<a href="http://www.kitware.com/products/protraining.php" target="_blank">http://www.kitware.com/products/protraining.php</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
<a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users" target="_blank">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>
</div></div></blockquote></div><br></div>