<div dir="ltr">multi-resolution set up is usually the key to such issues.<div><br></div><div>but greater detail in your question / code is needed.   </div><div><br></div><div>syn & variants are applicable for a broad range of images</div>

<div><br></div><div>as you can see in the literature & documentation.</div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div><br></div>brian<br><div><br></div><div><br></div></div>
<br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jan 22, 2014 at 11:57 AM, Emma Saunders <span dir="ltr"><<a href="mailto:emmasaunders123@gmail.com" target="_blank">emmasaunders123@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

<div dir="ltr">Thanks Nick and Brian for your input.<div><br></div><div>I was attempting to change the learning rate as I am having poor results using both syn and itkBsplinesyn when registering two MR images of the entire thorax during respiration.  Are these methods specifically designed for certain types of images (e.g brain).  I initialize my framework with an Affine transform, using mattes MI, the metric value first falls off and then increases.  The result is thus only a small amount of movement, around 1/3 of what I would hope for.</div>


<div><br></div><div>I can successfully register the images with a regular Bspline method using ITK, but was hoping to get a SYN method working in order to have a valid inverse.</div><div><br></div><div>I suppose the question is, if I can get regular Bspline to give a descent result should the same hold for the SYN methods or am I missing something?</div>


<div><br></div><div>Thanks for your help</div><div><br></div><div><br></div></div><div class="HOEnZb"><div class="h5"><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jan 22, 2014 at 3:30 PM, Emma Saunders <span dir="ltr"><<a href="mailto:emmasaunders123@gmail.com" target="_blank">emmasaunders123@gmail.com</a>></span> wrote:<br>


<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi all<div><br></div><div>I am trying to use the Syn methods mentioned above.</div><div><br></div><div>

I would simply like to set my framework up to estimate the learning rate at each iteration.  So far this has proved problematic as the optimization process is contained within the methods itself and whenever I try to find a solution need to look through ANTS header files and I still have no luck.</div>



<div><br></div><div>Is there a simple way to set the learning rate given a scaleEstimator for these methods (without using the ans registration helper ) or must one simply choose one at the beginning and hope for the best??</div>



<div><br></div><div>I am also finding it difficult to determine which optimizer these methods use as in the ANTS headers there are two options a GradientDescent and a conjugate gradient descent, any ideas??</div>
<div><br></div><div>I initially used the ITK libraries as they provided a method that I could begin using state of the art image processing algorithms without the steep learning curve, is there any pending documentation or software guide for the new ITKV4 framework.</div>



<div><br></div><div>Thanks</div><span><font color="#888888"><div><br></div><div>Emma</div></font></span></div>
</blockquote></div><br></div>
</div></div></blockquote></div><br></div>