<div dir="ltr">Hi Jose,<div><br></div><div>Yes, your intuition is correct in this case.</div><div><br></div><div>If you keep the images as a 4D image, the interpolator will</div><div>indeed blend values across time points. Since after all, they</div>
<div>are just seen as another spatial dimension.</div><div><br></div><div><br></div><div>You may want to do the 3D resampling within the original</div><div>3D images, before you compose them into a 4D image.</div><div><br>
</div><div><br></div><div>Note that since ITK 4.0 there is a set of classes in ITK</div><div>for managing ND+Time.</div><div><br></div><div><br></div><div>You will find them under</div><div><br></div><div>                /ITK/Modules/Video/Core/include<br>
</div><div><br></div><div><br></div><div>In particular,</div><div>you may find interesting the class</div><div><br></div><div>                         itkVideoStream.h<br></div><div><br></div><div><br></div><div>where you could put 3D images into a time sequence.</div>
<div><br></div><div><br></div><div>    Thanks</div><div><br></div><div>         Luis</div><div><br></div><div><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Feb 18, 2014 at 4:40 PM, Jose Ignacio Prieto <span dir="ltr"><<a href="mailto:joseignacio.prieto@gmail.com" target="_blank">joseignacio.prieto@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi all, I am trying to upsample an image using this example as base <a href="http://www.itk.org/Doxygen/html/Filtering_2ResampleVolumesToBeIsotropic_8cxx-example.html#_a5" target="_blank">http://www.itk.org/Doxygen/html/Filtering_2ResampleVolumesToBeIsotropic_8cxx-example.html#_a5</a><div>

I have MRI cine data with spacing like 1:1:8. I mounted all time frames into a 4D image and I would like to upsample on Z axis to get 1:1:1. I was wondering if I should better divide the 4D image  into a vector of 3D images so the interpolator wouldn't mix different times frames or it doesn't matter. ( also because I am interested in performance). Is it ok to use the linear interpolator for MRI? Or I should use BSPline? If so, is it faster to work on 3D  for the splines?? </div>

<div><br></div><div>Thank you very much</div><div><br></div><div>Ignacio Prieto</div><div><br></div><div>Software Developer</div><div>Biomedical Imaging Center</div><div>Pontificia Universidad Católica de Chile</div></div>

<br>_____________________________________<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at<br>
<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
<a href="http://www.kitware.com/products/protraining.php" target="_blank">http://www.kitware.com/products/protraining.php</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
<a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users" target="_blank">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users</a><br>
<br>_______________________________________________<br>
Community mailing list<br>
<a href="mailto:Community@itk.org">Community@itk.org</a><br>
<a href="http://public.kitware.com/cgi-bin/mailman/listinfo/community" target="_blank">http://public.kitware.com/cgi-bin/mailman/listinfo/community</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>