<div dir="ltr">Bradley,<div>The solution I am using in my application has been to explicitly set the ImageIO to the ImageFileReader so this is no longer a problem form me, I just wanted to let everyone know this is an issue.  I appreciate your help</div>
<div>Thanks,</div><div>Scott</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, May 21, 2014 at 2:15 PM, Bradley Lowekamp <span dir="ltr"><<a href="mailto:blowekamp@mail.nih.gov" target="_blank">blowekamp@mail.nih.gov</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div style="word-wrap:break-word">Hello,<div><br></div><div>If it's just the HDF5ImageIO module that is causing the threading issue, then have you considered just disabling that ITKModule when building ITK?</div>
<div><br></div><div>You may also be able to explicitly set the ImageIO to the ImageFileReader, so that that IOFactory is not used to determine the ImageIO to use.</div><div><br></div><div>Hope that helps,</div><div>Brad</div>
<div><br><div><div><div class="h5"><div>On May 21, 2014, at 3:46 PM, Scott Pfeifer <<a href="mailto:scottfivefour@gmail.com" target="_blank">scottfivefour@gmail.com</a>> wrote:</div><br></div></div><blockquote type="cite">
<div><div class="h5"><div dir="ltr">Hi all,<div> I have found what seems to be a bug in IOFactory which seems to be a threading issue.  I do not have a fix for it but I have a small program which reproduces the issue.  I will attach the files.  <div>

<br></div><div>The fix I have for the situation is to either put a mutex around all itkIamgeFileReader::Update()'s of assign the ioObject if I already know what sort of image I am dealing with.</div><div>You will have to change the file names to some mhd files you have, if you need me to provide some I can do that.</div>

<div><br></div><div>to make the problem go away here just uncomment line 24 or 32 in ItkTestThreadSupport.cpp</div><div><br></div><div>I am running Itk 4.5.2 and boost 1.55</div><div><br></div><div>If I can be of any assistance I would be happy to hel p- my stack trace looks like this</div>

<div><br></div><div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">H5MM_xfree()</div>

</div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">H5E_preintf_stack()</div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">H5E_clear_starck()</span><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">isHdf5()</span></div>

<span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">HDF5ImageIO::CanReadFile()<br></span><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">ImageIOFactory::CreateImageIO(</span><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">)</span><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">>::GeneraterOutputInformation(</span><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">) line 116</span><div>

<span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">ImageFileReader<itk::image<</span><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">short,3> itkDefaultConvertPixelTrats<</span><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">short> </span></div>

<span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">ProcessObject::</span><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">UpdateOutputInformation()</span><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">ImageBase<3>::</span><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">UpdateOutputInformation()</span></div>

<span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">DataObject::Update()</span><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">ProcessObject::update()</span><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><br>

</span></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><br></span></div></div></div>
</div></div><span><itkLoadTestMain.cpp></span><span><ItkTestThreadSupport.cpp></span><span><ItkTestThreadSupport.h></span>_____________________________________<br>Powered by <a href="http://www.kitware.com" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>Visit other Kitware open-source projects at<br><a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br><br>Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
<a href="http://www.kitware.com/products/protraining.php" target="_blank">http://www.kitware.com/products/protraining.php</a><br><br>Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br><a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br>
<br>Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br><a href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users" target="_blank">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users</a><br>_______________________________________________<br>
Community mailing list<br><a href="mailto:Community@itk.org" target="_blank">Community@itk.org</a><br><a href="http://public.kitware.com/cgi-bin/mailman/listinfo/community" target="_blank">http://public.kitware.com/cgi-bin/mailman/listinfo/community</a><br>
</blockquote></div><br></div></div></blockquote></div><br></div>