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00017 #ifndef __itkBioGene_h
00018 #define __itkBioGene_h
00019
00020 #ifdef _MSC_VER
00021 #pragma warning ( disable : 4786 )
00022 #endif
00023
00024 #include <string>
00025 #include <vector>
00026 #include <map>
00027
00028 namespace itk {
00029
00030 namespace bio {
00031
00041 class Gene
00042 {
00043 public:
00044 typedef std::string NameType;
00045 typedef std::string DomainType;
00046 typedef double AffinityType;
00047 typedef std::map< DomainType, AffinityType > ProteinDomainsType;
00048
00049 typedef struct
00050 {
00051 DomainType m_Domain;
00052 bool m_Type;
00053 } ControlDomainType;
00054
00055 typedef std::vector< ControlDomainType > GeneControlDomainsType;
00056
00057 public:
00058 Gene();
00059 virtual ~Gene();
00060
00061 void Copy( const Gene & genome );
00062
00064 void SetName( const NameType & name );
00065 void SetName( const char * name );
00066 const char * GetName() const;
00068
00074 void AddProteinDomain( const DomainType & domain, AffinityType affinity );
00075
00076
00080 void AddGeneControlDomain( const DomainType & domain, bool type );
00081
00082 private:
00083 NameType m_Name;
00084 GeneControlDomainsType m_ControlDomains;
00085 ProteinDomainsType m_ProteinDomains;
00086 };
00087
00088
00089 }
00090
00091 }
00092
00093 #endif
00094