<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">Hi Elli,</div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">what you seem to want to do it apply the same transform to both your original image and its mask. There is normal image <a href="https://itk.org/Doxygen/html/classitk_1_1ResampleImageFilter.html">resampling</a> (read more about it in the <a href="https://itk.org/ITKSoftwareGuide/html/Book2/ITKSoftwareGuide-Book2ch3.html#x26-1000003.2">software guide</a>). And there is also <a href="https://www.slicer.org/wiki/Documentation/Nightly/Modules/Transforms">hardening</a> of linear transforms (affine, rigid etc), where only the image's meta-data is modified, but pixel data is untouched.</div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">Regards,</div><div class="gmail_default" style="font-family:verdana,sans-serif;font-size:small">Dženan</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Thu, Jun 21, 2018 at 12:03 PM Elisabeth Pfaehler <<a href="mailto:elli.pfaehler@gmail.com">elli.pfaehler@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Dear all,</div><div><br></div><div>I have one question:</div><div><br></div><div>I have an image and a corresponding mask with a label marking a tumor region.</div><div>I interpolate now both images using tri-linear interpolation. For aligning mask and image, I set in both cases the output origin to the origin of the original image.</div><div>So far, everything is very fine. But now, I have the task to align the interpolated image grid of both image and mask so that the grid centers correspond for image and mask. I do not know if I was very clear with what I want to do, but is there any way to align interpolated image grids to the grid center and not the origin using ITK?</div><div><br></div><div>Thanks a lot for your help,</div><div><br></div><div>Elli<br></div><div><br></div></div>
The ITK community is transitioning from this mailing list to <a href="http://discourse.itk.org" rel="noreferrer" target="_blank">discourse.itk.org</a>. Please join us there!<br>
________________________________<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" rel="noreferrer" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at<br>
<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
<a href="http://www.kitware.com/products/protraining.php" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.kitware.com/products/protraining.php</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
<a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="https://itk.org/mailman/listinfo/insight-users" rel="noreferrer" target="_blank">https://itk.org/mailman/listinfo/insight-users</a><br>
</blockquote></div>